药用模式真菌灵芝小G蛋白基因家族的系统性分析_任昂.pdfVIP

药用模式真菌灵芝小G蛋白基因家族的系统性分析_任昂.pdf

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南京农业大学学报 2015 ,38 (6):923-929 http :/ / nauxb. njau. edu. cn Journal of Nanj ing Agricultural University doi :10 . 7685 /j . issn. 1000 -2030 . 2015 . 06. 008  , , , . G [J]. ,20 15 ,38 (6):923 -929 任昂 曹鹏飞 吴凤礼 等 药用模式真菌灵芝小 蛋白基因家族的系统性分析 南京农业大学学报 G 药用模式真菌灵芝小 蛋白基因家族的系统性分析 * , , , , , , 任昂 曹鹏飞 吴凤礼 李梦娇 姜爱良 师亮 赵明文 ( / , 210095) 南京农业大学生命科学学院 农业部农业环境微生物重点实验室 江苏南京 :[ ] , G 摘要 目的 利用比较基因组学方法 对药用模式真菌灵芝的基因组中的小 蛋白基因家族成员进行系统的预测分析和 。 [ ] G , BLAST , G , 比较 方法 利用真菌物种中已经报道的小 蛋白 对灵芝全基因组进行 分析 筛选出所有灵芝的小 蛋白基因 G 。 G , G 并分析这些同源小 蛋白的基本特性 通过小 蛋白家族的进化树分析和功能域分析 解析灵芝小 蛋白家族成员的进 。 G , PCR G 。 [ ] 化关系 设计每一个小 蛋白同源基因的特异性引物 通过实时荧光定量 检测小 蛋白同源基因的表达 结果 在 29 G , Ras 4 ,Rho 4 ,Rab 12 ,Arf 7 ,Ran 灵芝中发现了 个小 蛋白家族基因 其中 亚家族 个 亚家族 个 亚家族 个 亚家族 个 亚家 1 , 1 G 。 28 G 。 [ ] G 族 个 还有 个线粒体小 蛋白 菌丝体中有 个小 蛋白基因表达 结论 根据真菌中已知的小 蛋白系统性地分 G

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