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In cRNA芯片技术服务
长链非编码RNA(IncRNA是一类转录本长度超过 200nt的RNA分子, 它们并不编码蛋白,而是以 RNA的形式在多种层面上(表观遗传调控、转录 调
控以及转录后调控等)调控基因的表达水平。随着越来越多的 In cRNA被发现,
人们开始关注到IncRNA在各种生物学过程以及疾病中所发挥的功能。通 过
In cRNA芯片,研究人员能够快速高通量地获得与特定生物学过程或者疾病相关 的IncRNA信息。
Ln cRNA芯片服务
我们为您提供美国Arraystar公司IncRNA芯片的全程技术服务,该芯 片覆盖目前所有权威数据库所注释的长链非编码 RNA是目前市面上唯一一款以
In cRNA为主,数据库版本最新,覆盖最全面的In cRNA芯片。
Arraystar 公司IncRNA芯片产品列表:
服务名称
U-R l_L 心片
规格 描述
Huma n In cRNA Microarray Service
Human In cRNA
Array
12X 135K
覆盖Refseq 18,874条蛋白编码 mRNA
以及 NCBI Refseq,UCSC Known Gene NRED
RNAdb等多个数据库的18,534条 In cRNA
Mouse In cRNA Microarray Service
Mouse In cRNA
Array Full
Versio n
4X 44K
覆盖 NCBI Refseq,UCSC Known Gene NRED
RNAdb Fantom3等多个数据库的 40,023 条 IncRNA
Mouse In cRNA
Array Stringent Versio n
4X 44K
覆盖Refseq 19,465条蛋白编码 mRNA
以及 NCBI Refseq,UCSC Known Gene NRED
Fantom3等多个数据库的13,868条
In cRNA(stri ngent)
Rat In cRNA
Microarray Service
Rat I ncRNA
Array
4X 44K
覆盖Refseq 15,283条蛋白编码 mRNA
以及 NCBI Refseq,UCSC Known
Gene,等多个数据库的9,319条
In cRNA
可靠的数据来源
IncRNA 芯片覆盖所有来自 Refseq (2009),UCSCCnownGene( 2009),
NRE(2009),RNAdb(2006), Fantom3等多个权威数据库注释为IncRNA的转 录本,并在此基础上收录了 相关文献中报道的IncRNA,是目前覆盖最为全面的 In cRNA 芯片。
优质的探针设计
Arraystar IncRNA芯片设计探针为~60mer的长寡核苷酸,这些长寡核
苷酸探针在高严谨杂交条件下可得到高灵敏度及高特异性的理想实验结果。
与mRN表达相结合
IncRNA 芯片还覆盖最新的Refseq数据库中所有mRN( protein
coding )的转录本。因此,在一次杂交实验中,可以同时检测 mRNA和IncRNA 的表达水平,并根据相关的 mRNAl达水平变化将鉴定出的IncRNA和已知的信 号通路联系起来。
常规IncRNA芯片研究流程
缶芯片赛定差异表达ImRNA
b.碾耘曲平额
链特异性RT-PC R验证表达差异
宁RACE 于RACE克隆全长
基因组定儘及序列保守性芬析
桃选特定兴趣卿蟻人硏究
桃选特定兴趣卿蟻人硏究
c. IncRNA*能研究
siRNA干扰外源过表达分析
表达谱芯片分析下游基因
康成生物IncRNA芯片技术服务实验流程
样品总RNA抽提
若实验对象为组织样品,取适量(50-100mg)新鲜组织样品或正确保存的组 织样品,加1ml的RNA抽提试剂Trizol (Invitrogen ),匀浆后抽提RNA
若实验对象为细胞样品,每份样品取 1X106~1X107细胞,完全吸去培养液 后加1ml的RNA抽提试剂Trizol (Invitrogen ),裂解后抽提RNA
RNA质量检测
使用Na nodrop测定RNA在分光光度计260nm 280nm和230nm的吸收值,以 计算浓度并评估纯度。
使用甲醛变性琼脂糖凝胶电泳检测 RNA屯度及完整性
cDNA样品合成和标记
芯片杂交
在标准条件下将标记号的探针和高密度基因组芯片进行杂交。
图像采集和数据分析
使用GenePix 4000B芯片扫描仪扫描芯片的荧光强度, 并将实验结果转换成
数字型数据保存,使用配套软件对原始数据进行分析运算。
提供实验报告
芯片扫描图
实验方法英文报告
RNA 质检报告
芯片数据结果报告,包括差异表达IncRNA列表,差异表达基因列表
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