发掘与水稻SD1相关的“隐藏”株高基因.pdfVIP

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2021-01-11 发布于江苏
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发掘与水稻SD1相关的“隐藏”株高基因.pdf

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发掘与水稻SD1 相关的“隐藏”株高基因目录摘要 i Abstract ii 缩略词表iii 1 前言 1 1.1 研究问题的由来 1 1.2 水稻SD1 基因研究进展 2 1.3 水稻株高研究进展 2 1.3.1 水稻株高的遗传研究 2 1.3.2 水稻株高的育种研究 3 1.4 赤霉素途径对株高的调控 4 1.4.1 赤霉素的发现 4 1.4.2 赤霉素的生物合成 5 1.4.3 赤霉素的信号转导 7 1.4.4 赤霉素的代谢失活 8 1.5 其它植物激素对株高的调控 9 1.6 BSA 法概述 11 1.6.1 BSA 法的原理 11 1.6.2 BSA 分析方法 12 1.7 研究目的与意义 13 2 材料和方法 14 2.1 研究材料 14 2.1.1 试验亲本材料 14 2.1.2 转基因材料 15 2.2 试验方法 15 2.2.1 田间种植及性状考察 15 2.2.2 F2：3 群体大样DNA 提取 16 2.2.3 BSA 测序数据分析 16 2.2.4 DNA 小样提取与PCR 扩增 17 2.2.5 定位群体及转基因材料基因型鉴定 18 I 华中农业大学2020 届硕士研究生学位论文 2.2.5 引物设计、合成以及测序 19 2.2.6 RNA 提取、cDNA 反转录以及Real-time PCR 19 2.2.7 载体构建 21 2.2.8 激素处理 22 2.2.9 数据统计分析 22 3 结果与分析 23 3.1 极端群体的表型及构建 23 3.2 利用NGS-BSA 定位株高位点 24 3.2.1 测序数据质量评估 24 3.2.2 SNP/InDel 位点的分布 25 3.2.3 QTL 定位结果 26 3.3 利用染色体片段代换系验证位点效应 27 3.3.1 利用染色体片段代换系验证qPH6 27 3.3.2 利用染色体片段代换系验证qPH8-1 28 3.4 qPH8-1 的定位与转基因验证 29 3.4.1 qPH8-1 的初步定位 29 3.4.2 qPH8-1 候选基因序列分析 31 3.4.3 转基因验证CYTB6、CYTB559、CYTF 32 3.5 CYTB6、CYTB559、CYTF 受GA3 诱导 33 4 讨论 35 4.1 测序群体的选择 35 4.2 利用NGS 和BSA 方法定位QTL 的优势 35 4.3 CYTB6、CYTB559、CYTF 是新的株高基因 36 4.4 CYTB6、CYTB559、CYTF 基因可能参与赤霉素代谢途径 37 4.5 qPH8-1 在育种中的应用 37 参考文献 38 附录Ⅰ试验所用引物信息 52 附录Ⅱ攻读硕士期间的研究成果 53 致谢 54