基因组遗传重组的分子机制.docVIP

PAGE PAGE 124 第四章 基因组遗传重组的分子机制 重组(recombination)是已经存在的遗传物质产生新的组合的过程。分子间或染色体间重组 (真核染色体减数分裂时独立分配和病毒基因组片段的重新分配); 而分子内或染色体内重组是酶依赖的过程，新的遗传物质通过DNA的剪切和连接产生。有五种类型的分子内重组，每种情况中分子反应——DNA剪切、双链间的链交换、DNA修复和去除——是相似的。 重组和突变是遗传变异的两种截然不同的机制：重组是已经存在的信息重排，而突变是在基因组中导入新的信息。突变和重组在分子水平上是相互关联的。很多重组事件(特别是转座和不正常重组)会导致基因破坏，这称为突变。相反的，一些重组是修复潜在突变或致死DNA损伤所必需。 重组的两种应用方式：对遗传座位作图和基因及基因组的操作。遗传作图根据染色体上两个基因座距离越远越容易发生同源重组的原理进行。因而一个特定杂交的重组产物的比例提供了对物理距离的估测。同源重组可被用于基因寻靶、而位点专一性重组可以诱导缺失和染色体重排。转座和不正常重组也被用来基因转移和整合。 分子内重组的不同类型： 1 同源重组 Homologous recombination (generalized recombination) involves a reciprocal exchange of sequences of DNA, e.g. between two chromosomes that carry the same genetic loci. 重组对之间需要有同源性。调节这一过程的蛋白(如大肠杆菌中的RecA)不是序列专一性的，而是同源依赖的。经常涉及长的同源区域(如减数分裂中)。 2 位点特异性重组 Site-specific recombination (Specialized recombination) occurs between two specific sequences, as in phage integration/excision or resolution of cointegrate structures during transposition. 重组对之间不需要同源性。调节这一过程的蛋白(位点特异性重组酶)在供体和受体分子中识别短的，特异DNA序列，这些蛋白之间的相互作用帮助重组。供体和受体位点之间经常存在同源性，因为同样的重组酶蛋白可结合两者的识别位点。 3 转座 Transposition refers to the movement of a transposon to a new site in the genome. 重组对之间不需要同源性。调节这一过程的蛋白(转座酶，整合酶)识别重组分子中的短特异序列，这样的序列称为转座因子(识别位点经常是转座因子和宿主DNA之间的接合处)。受体位点一般在序列上相对非特异，重组将可转座因子整合到宿主DNA中(见第13章可移动的遗传因子)。 4 不正常重组 重组对之间不需要同源性或少量同源性，是异常细胞作用的结果。包括复制中不正常末端连接，链滑动或成环。不等交换(参阅)经常被描述成不正常，尽管其机制是正常的(但在错误的地方发生)同源重组。 5 人工重组 体外用纯化的酶和底物进行的DNA连接引起的重组。 Copy choice is a type of recombination used by RNA viruses, in which the RNA polymerase switches from one template to another during synthesis. 第一节 The Holliday Model （霍利迪模型） 狭义的遗传重组专指因为DNA分子内断裂—接合而引起基因交流的过程。 遗传重组 同源重组 （homologous recombination） 位点特异性重组 (site-specific recombination) 转座重组 (transpositional recombination ) 异常重组 (illegitimate recombination) 同源重组有时又叫交换（crossing over），它发生在DNA同源序列之间。 一、Holliday model for reciprocal genetic recombination 1964年，R.Holliday设想了一个模式，用来解释同源重组，经过许多细节上的修改： 1、同源染色体的识别和配对排列 2、两条多核苷酸链在对应位置断裂并相互侵入（交换） 3、酶