20-第8章 lncRNA基因组学.pdf

第8章 转录物组 lncRNA--基因组暗物质 1) 什么是lncRNA? 2) 发现lncRNA 3) 基因组lncRNA 4) lncRNA 的生物学功能 什么是lncRNA？ 1）lncRNA是long non-coding RNA的简称，即 长非编码RNA 。 2 ）lncRNA 由Pol II RNA聚合酶转录, 具有 mRNA的结构特征但无编码功能。 3 ）lncRNA一般长度大于200 nt, 缺少功能的 ORF (开放读框) 。 发现lncRNA 1）第一个lncRNA-H19 2 ）第一个功能lncRNA-SRA 3 ）失活X染色体lncRNA-Xist RNA 第一个非编码mRMA—H19 H19基因是在筛选 与a-甲胎蛋白 (AFP)协同表达 cDNA克隆实验中发 现的，是胎儿肝脏 组织细胞中的丰度 mRNA。 H19基因在 成年个体组织中表 达量下降600倍。 H19基因含5个外显 子， mRNA全长2.3 kb, 小鼠H19 mRNA 潜在的ORF共有35 个，但缺少跨越2 个连续外显子的 Molecular and Cellular Biology 10:28- 36, 1990 ORF。 SRA是类固醇受体RNA激活 第一个功能lncRNA 因子（Steroid receptor RNA activator ）的简称 ，是第一个阐明具有功能 的非编码RNA ，可反式 激活增加类固醇受体蛋白 的活性 Cell 97:17-27 ，1999