石蜡组织的dna提取步骤.docxVIP

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QIAamp DNA Mini Kit (50), 货号: 51304 材料: 二甲苯 无水酒精 QIAamp DNA Mini Kit , 货号: 51304 ( ALT Buffer,, 蛋白酶 K,RNase A, AL buffer, QIAamp Spin Column, AW1buffer, AW2 buffer, AE buffer ) 一.提取具体步骤: 取不超过 25毫克的石蜡组织放在 1.5 毫升的离心管中(不提供)。 加1200卩I的二甲苯,震荡器剧烈混合(涡流)。 室温下14000rpm离心5分钟(15 - 25° C)。 用枪吸去上清,不要碰到下面的沉淀。 加1200ul的酒精(96-100%),以便洗去残留二甲苯,用震荡机轻轻震 荡。 室温下14000rpm离心5分钟(15 - 25° C)。 用枪小心吸去酒精,不要碰到下面的沉淀。 重复 5-7 步。 放置一定时间( 37度条件下孵育 10-15 分钟),直到酒精完全挥发。 把沉淀悬浮在180ul的ATL Buffer (如果缓冲液产生沉淀,需要在56度 中孵育溶解 )中。 加20ul的蛋白酶K。用震荡器充分混合,56度孵育直到组织完全溶解。 (从孵育到组织的溶解过程中需要 不时振荡,不同组织溶解时间不同,通 常是1-3小时。样品可以反应 过夜,这不会影响DNA勺制备。为了保证有效的裂解, 应该在摇动的水浴或摇床上进行; 如果没有此条件, 可以在孵育过程中, 每小时 晃动2-3次)。 12?将1.5ul的离心管进行短暂离心,以便除去盖子内部的水滴。 13.继续步骤3a。(或者如果需要不含RNA勺基因组DNA继续步骤3b) 说明:转录活性组织如肝脏和肾脏,含丰富的RNA(将和基因组DNAr起被纯 化)。RNAT以抑制一些下游的酶反应,但是不会影响 PCR 3a加入200ulAL buffer到样品中,用脉冲震荡器震荡15s,短暂离心以便 除去盖子内部的水滴 ,70 度下孵育 10min,。 3b加入4 ul的RNase A( 100mg/ml),脉冲震荡器震荡15s,在室温下孵育 2min,再加入200ulAL buffer ,通过脉冲震荡器再混合15s, 70度孵育10min,短 暂离心。 (样品和AL buffer充分混匀是很重要的。加入AL buffer可能会产生白色的 沉淀。在大部分情况下,沉淀能在 70度的孵育下溶解) 14?给样品加入200ul的酒精(96-100%),脉冲震荡15s,短暂离心。 (样品、AL buffer和酒精彻底混匀是很重要的。加入酒精时可能会产生白色 的沉淀。把所有的沉淀用于 QIAampSpin Column是很重要的。沉淀不妨碍QIAamp 反应程序或者任何此后的应用。 ) 不要使用除了酒精之外的乙醇,因为这将会减少产量。 小心地把从步骤14获得的混合物(包括沉淀)倒在QIAamp Spin Column (一个2ml的收集管中),注意不要把边沿弄湿,扣好盖子,在 8000rpm下离心 1min。把QIAamp Spin Column放进干净的2ml收集管中(提供),丢掉含有虑出 液的管。 小心地打开QIAamp Spin Column的盖子,加入500ul的AW1buffer(不要 弄湿边沿)。盖上盖子,在8000rpm下离心1min,把QIAampSpin Column放在2ml 集液管中 (提供),弃去有滤液的管子。 小心地打开QIAamp Spin Column,加入500ul的AW2 buffer (不要弄湿 边沿)。盖上盖子,14,000rpm下离心3min。弃去有滤液的管子。 (可选择) 把QIAampSpin Column放在一个干净的2ml收集管[不提供]中, 14,000rpm下离心1min,弃去有滤液的管子。 把QIAamp Spin Column放在一个干净的1.5ml微分离心管[不提供]中, 小心地打开QIAamp Spin Column的盖子,并加入200ul (100?) AE buffer或者 蒸馏水。室温下孵育1min,然后8000rmpS心1min。 重复步骤 18。 (离心前把装有AE buffer或蒸馏水的QIAamp Spin Column孵育5min,—般 都会增加DNAr量) (在第三步中,用200ul的缓冲液AE额外进行洗涤,将使产量增加15%) 对于长期储藏的DN屎说,推荐在AE缓冲液中洗涤并且放在-20 C下。因为在 水中储藏的DNAJ能被酸水解。 DNA勺产量将依赖于处理过程中组织的数量和组织类型。25mg勺组织在400ul 的水(25-75ng/ul )中将产生大约10-30ug的DNA在A260/A280吸收比率为.7-1.9 。 kit concen t

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