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c服务内容和要求 （一） 服务内容 对100个某动物样本进行全基因组重测序，获得该物种?然群体各亚群的基因组信息，并得到大量的 SNP变异信息，分析该物种的遗传多态性，揭示该物种种群和个体差异。 （二）服务要求 1、测序要求使用Illumina Novaseq测序平台进行测序，测序读长为2X150bp，对该物种进行基因组DNA序列测定。构建文库为350bp小片段文库，测序质量Q20 ≥ 95%、Q30 ≥90%。 2、测序深度为每个样本不低于5X的测序深度。 3、在收到样本并质检合格后，保证样本在 40个自然日内完成项目内容。 4、要求操作人员有严格的培训和评估并且有严格的流程管理。 5、数据分析过程要求 5.1数据质控及产出统计 5.2 比对参考基因组 5.3 SNP 检测及注释 5.4群体 SNP 过滤 5.5 群体遗传多态性分析 （1）群体进化树分析 （2）群体主成分分析 （3）群体遗传结构 5.6 种群历史动态分析 5.7群体选择分析 （1）连锁不平衡分析 （2）选择消除分析 5.8基因功能富集分析 （三）验收标准 1、每个样品的测序总数据量达到12G以上； 2、每个样品的测序深度不低于5X的测序深度； 3、原始数据的测序质量Q20 ≥ 95%、Q30 ≥90%； 评标方法及标准 1、评标原则 评标活动遵循“公平、公正、科学、择优”的原则。 2、评标委员会 招标方将根据项目的特点依法组建评标委员会，评标委员会负责审标、询标、评审等工作。 3、评分标准 序号 评分因素 分值 评分细则 1 投标报价部分 （20分） 20 满足招标文件要求且投标价格最低的投标报价为评标基准价，其价格分为满分。其他投标人的价格分统一按照下列公式计算： 投标报价得分=(评标基准价／投标价)×20%×100。 备注：根据《政府采购促进中小企业发展暂行办法》（财库[2011]181号）第五条要求，本项目对小型和微型企业报价给予6%的扣除，用扣除后的投标报价参与评审。 2 商务部分（20分） 投标人资质证书 5 1、具有Illumina CSPro高通量测序服务商认证。 2、具有ISO9001质量管理体系认证； 3、获得国家高新技术企业证书； 4、通过NGS实验室的CAP认证； 5、国内或国外具有通过CLIA认证的实验室； 每提供一种认证证明材料得1分。（须提供相关证明材料复印件为准，并加盖单位公章，否则不得分） 投标人实力情况 10 1、投标人自主拥有自有的Illumina测序设备（HiseqX），少于13台不得分；13台-17台的得2分；18台及以上的得4分。（需提供仪器设备的采购合同或者发票、清单的复印件作为凭证，否则不得分） 2、投标人拥有自有的Novaseq测序设备，少于13台不得分；13台-17台的得2分；18台及以上的得4分。（需提供仪器设备的采购合同或者发票、清单的复印件作为凭证，否则不得分） 3、投标人配备ION S5 XL SYSTEN基因测序设备2台及以上得2分，其余不得分。（ 需要确认仪器采购合同名称，是否是购销协议，否则不得分） 以上三项累计得分，总计10分。 文章实力 5 投标人2013年至投标截止日前作为共同第一作者或共同通讯作者发表过动物或植物基因组重测序方面的高水平文章，且文章影响因子（IF）≥20的文章，每提供一篇得1分，满分3分。（须提供文章首页并加盖投标单位公章，否则不予计分。文章参与作者人员必须隶属投标人单位，投标人单位未作为署名单位的论文，不计入） 投标人在2013年至投标截止日之前所参与的动植物重测序项目的发表文章，且影响因子≥12的文章，每提供一篇得0.5分，满分2分。（项目发表文章需标注公司名称并加盖投标单位公章，否则不予计分） 3 技术服务部分 （60分） 项目实施方案 20 根据各投标人针对本次项目实施和技术方案进行打分： 1、具有有针对性，合理性和可操作性的详细项目实施方案以及工作计划安排合理，得15-20分； 2、项目实施方案基本符合项目实施需求，工作计划安排基本合理，得10-14分； 3、项目实施方案不符合项目实施需求，且工作计划安排不得当，得1-9分。 人员配备计划 10 根据各投标人的人员配备方案进行横向比较： 1、技术人员队伍配备结构合理、经验丰富，得8-10分； 2、技术人员队伍配备结构基本合理、经验较丰富，得5-7分； 3、技术人员队伍配备简单，基本无经验的得1-4分。 （提供以上人员的身份证、学历证书、简历等证明材料复印件作为考评依据，否则不得分） 技术要求响应情况 20 完全响应招标文件的技术要求，得20分；每有一项负偏离的扣2分，扣完为止。 服务保障 10 有专门售后体系及负责团队，售后服务承诺能够充分满足招标人的需求，绝对保证数据安全。 1、优秀