十 分子进化和分子系统学.pdfVIP

第十章 分子进化和分子系统学 一、什么是分子进化？ 分子进化有两层含义，一是指原始生命出现之前的进化，即生命 起源的化学演化；二是原始生命产生之后生物在进化发展的过程中， 生物大分子结构变化以及这些变化和生物进化的关系. 二、分子进化的特点 （一）分子进化速率的恒定性 （二）分子进化的保守性不同 （一）分子进化速率的恒定性 1. 什么是分子进化速率？ 指蛋白质和核酸等生物大分子在进化过程中核苷酸或氨 基酸残基发生替换的频度。 2. 进化速率的计算 1) 氨基酸差异比例的计算 P =d /N d aa aa daa 为用于比较的同源蛋白质之间氨基酸差异的数目 Naa为蛋白质氨基酸的总数  人与鲨鱼之间血红蛋白α链相差74个, 血红蛋白α链 氨基酸总数为139: P =d /N =74/139=53.2% d aa aa 蛋白质现存的差异，往往比实际氨基酸的替换总数要小. 因为有些氨基酸实际上虽然发生了替换，但不能被统计.  两个物种的相同蛋白质分子在相同位置各发生了一个氨