第四章-序列比对与算法.pptVIP

* * 2021/3/17 * ClustalX介绍 2021/3/17 * ClustalX介绍 2021/3/17 * ClustalX介绍 2021/3/17 * ClustalX介绍 2021/3/17 * Example Multiple sequence alignment of 7 neuroglobins using clustalx 2021/3/17 * PILEUP PILEUP是GCG(Genetics Computer Group)软件包中的MSA分析工具; 与CLUSTAL一样使用累进式整体比对方法(Progressive Global Alignment); PILEUP开始的双序列比对使用Needleman-Wunsch动态规划算法,所以是全局序列比对,善于比较相似度较高的序列。 2021/3/17 * Output of Pileup 401 OATNFA1 TTCAG..... .ACACTCAGG TCATCTTCTC AAGC OATNFAR TTCAG..... .ACACTCAGG TCATCTTCTC AAGC BSPTNFA TTCAA..... .ACACTCAGG TCCTCTTCTC AAGC CEU14683