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微生物全基因组范围内的最小基因组研究进展
微生物全基因组范围内的最小基因组研究进展
摘要:最小基因组是当前合成生物学研究的热点,从全基因组代谢网络研究入手,介绍了最小基因组研究的必要性和技术方法,并对其在工业微生物分子育种中的应用进行分析,综合阐述了最小基因组研究的发展前景。
关键词:微生物;全基因组;最小基因组;分子育种
中图分类号:Q933;Q344+.13文献标识码:A文章编号:
1001-3547(2013)24-0009-03
基因组代谢网络
如今,伴随着高通量测序技术的应用和费用的降低,全基因组测
序技术也越来越受欢迎。通过基因组测序,对基因进行功能注释,把基因编码蛋白所催化的生化反应称为一个代谢网络,通过计算机转化为数学模型,再用试验数据加以验证,提出假设,能够对生物体以及
生物现象作出预测,是合成生物学研究中的一个重要的研究手段 [1]。
研究最小基因组的必要性
最小基因组是指在最合适的条件下维持细胞生长繁殖所必需的
最少基因[2],优势小基因组菌株是指含有特殊功能基因/簇的最小基因组菌株。通过对菌株基因组的减缩,可以达到如下目的:①可以提高菌株的代谢效率、降低代谢冗余;②基因组越小,微生物生长速度越快;③增加目标产物合成量,消除副产物[3~5],解决目前发酵产业中存
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