简介(INTRODUCTION )
原理:Gibson assembly是一种one step, one pot的快速基因组装方法。它只需要将基因片段 和需要的三种酶混合在同一个管内在 50°C下培养15-60 min就可以得到组装好的 DNA。
装配原理基于 DNA片段间的重叠区域, 过程依赖于三种酶: DNA外切酶(T5 exonuclease),
ctsDNA iragmente wrfh oueiiaopna ends
A
A+B
Fully DNA
高保真 DNA聚合酶。(Phusion polymerase )和耐热 DNA连接酶 (Taq DNA ligase)的共同 作用。首先,T5核酸外切酶消化 DNA片段的链 方向是从5到3每个DNA片段分别形成 一个单链的突出部分,由于着这两个相邻的突出片段有一部分具有同源性能够互补,所以
DNA片段退火,互补的序列重新配对连接。然后,在空缺的部分 DNA聚合酶以另一条 DNA
单链为模板,沿 3方向将对应的脱氧核苷酸连接到单链上,填补缺口。最后,连接酶将两 条DNA单链黏合起来,密封裂缝。这样具有重叠区域的 DNA片段就组装成一整条 DNA分
子了。下面是组装的示意图。
材料(MATERIALS )
试齐U( REAGENTS
NAD,H2O , 1 M MgCl2, 1 M DTT, 10 mM dNTP mix, 1 M
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