生物信息学引论.ppt

生物信息学;相关信息;精品资料; 你怎么称呼老师？ 如果老师最后没有总结一节课的重点的难点，你是否会认为老师的教学方法需要改进？ 你所经历的课堂，是讲座式还是讨论式？ 教师的教鞭 “不怕太阳晒，也不怕那风雨狂，只怕先生骂我笨，没有学问无颜见爹娘 ……” “太阳当空照，花儿对我笑，小鸟说早早早……”;“虽然生物信息学已经在国外得到蓬勃的发展，但是国内相关书籍的水平还十分参差不齐，至今仍没有一本非常翔实的中文教材。” ——《生物信息学与功能基因组学》中文译者，2006年 本教材（《生物信息学应用技术》王禄山主编）仅作为教学参考用书。 本课程的教学参考了“Bioinformatics and Functional Genomics”（Wiley, 2nd edition 2009）及其网络教程： ;*;教 材;教 学;What you need before the course ?; 授课教师：刘红美 授课时间：2016年9月;绪论：什么是生物信息学？;绪论：什么是生物信息学？;一、生物信息学产生的背景 ;近二十年来生物信息学的成长基于一个简单的 原因： 数据数据数据 数据数据 数据;;一、生物信息学产生的背景;一、生物信息学产生的背景;一、生物信息学产生的背景 ;Growth of GenBank;;Arrival of next-generation sequencing: approaching 100 terabases (100,000 gigabases) in 2009;GENBANK AND WGS STATISTICS;;生物信息学 基本思想产生 ;HGP 生物数据的激增;一、生物信息学产生的背景;生物信息学将传统生命科学的“二元研究”分化为“三足鼎立”状态;绪论：什么是生物信息学？;;;*;二、生物信息学的定义;二、生物信息学的定义;绪论：什么是生物信息学？;三、生物信息学研究的主要内容;三、生物信息学研究的主要内容;三、生物信息学研究的主要内容;*;由深圳华大基因研究院发起，中国科学院昆明动物研究所等参与的合作研究成果《The sequence and de novo assembly of the giant panda genome》于2010年1月21日以封面故事发表于《nature》杂志。 本研究是全球第一个完全使用新一代合成法测序技术完成的基因组序列图，该成果证明了短序列也能组装成完整基因组，并将成为基因组绘图的国际标准。 SOAP基因组序列分析软件包可以高效地处理第二代测序技术产出的巨大数量的短序列，并完成其参考序列的定位上，短序列的组装以及序列差异分析等。;;三、生物信息学研究的主要内容;三、生物信息学研究的主要内容;序列比对要考虑的问题之一 ;;肌红蛋白;三、生物信息学研究的主要内容;三、生物信息学研究的主要内容;;三、生物信息学研究的主要内容;三、生物信息学研究的主要内容;三、生物信息学研究的主要内容;三、生物信息学研究的主要内容;Pace (2001) described a tree of life based on small subunit rRNA sequences. 该分子进化树提示： 与细菌相比，古细菌在进化关系上与真核生物更为接近。;;人类1号染色体 与小鼠1-19、X 和Y染色体之间 约44000个同线 性关系 桔黄色连线突出 显示小鼠4号染 色体与人类1号 染色体上的所有 同线性关系 ;三、生物信息学研究的主要内容;三、生物信息学研究的主要内容;;三、生物信息学研究的主要内容;三、生物信息学研究的主要内容;;三、生物信息学研究的主要内容;*;三、生物信息学研究的主要内容;本课程主要学习的内容;Half day on the web,