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PAGE PAGE #/24 考研笔记：生物化学复习知识点 静态生物化学一结构和催化作用 1.1氨基酸、多肽和蛋白质 部分氨基酸的特殊性质： 蛋白质中的氨基酸都是L型的，D型仅存在于细菌细胞壁上的小肽或抗菌肽中； 只有lie和Thr有两个手性碳原子，Gly是唯一不含手性碳原子的AA,因此不具旋光性； Ser、Thr、Tyr,这些AA残基的一OH上磷酸化是一个十分普遍的调控机制，可进行可逆性磷 酸化，可有效地控制细胞的生长和机体的各种反应； Asn、Gin在生理pH范用内其酰氨基不被质子化，因此侧链不带电荷； Cys,在pro经常以其氧化型的胱氨酸存在，-S-S-二硫桥； His是唯一一个R基的pka值在7附近的AA,因此在PH7.0附近有明显的缓冲作用； Phe：它的浓度的测定被用于苯丙酮尿症的诊断； Met 乂称蛋氨酸，它是体内代谢中甲基的供体。（SAM—S-腺昔蛋氨酸）： A280： Trp、Tyr和Phe残基的苯环含有共钝双键； Trp显现磷光，是一种寿命较长的发射光，对研究蛋白质结构和动力学特别有用。 近年发现谷胱甘肽过氧化物酶中存在硒代半胱氨酸，有证据表明此氨基酸由终止密码UGA编码， 可能是第21种蛋白质氨基酸。 氨基酸分类 按照R基的极性性质（能否与水形成氢键）20种基本眈，可以分为4类： 非极性氨基酸（9种）、不带电何的极性氨基酸（6种）、带负电荷的瞪（酸性眈，2种）、带正电何 的且a （碱性且且，3种） 酶的活性中心:His、Ser、Cys 氨基酸的化学性质 所有的a-AA都能于前三酮发生颜色反应生成紫色物质，570nm测定；Pro和轻脯氨酸生成壳黄 色，440nm测定；在近紫外区（200-400nm）只有芳香族AA有吸收光的能力，含有共轨双键的化合 物有吸收紫外光的特性，紫外吸收法定量蛋白质的依据；TrpTyrPhe（紫外吸收能力）在280nm有 最大光吸收。 天然存在的活性肽： I谷胱甘肽：Glu-Cys-Gly：红细胞中的疏基缓冲剂，参与氧化还原过程，清除内源性过氧化物 和自由基，维护蛋白质活性中心的裁基处于还原状态。 II 丫-鹅膏草碱：环状八肽，能与真核生物RNA聚合酶II牢固结合而抑制该酶的活性，使RNA合 成不能正常进行，但不影响原核生物的RNA合成。 III脑啡肽（5肽）IV短杆菌肽（抗生素）V肽类激素：牛催产素、牛加压素、舒缓激肽 蛋白质一级结构的测定 pro测定的策略：测定蛋白质分子中多肽链的数口、拆分蛋白质分子中的多肽链、测定多肽链的 氨基酸组成、断裂链内二硫键、分析多肽链的N末端和C末端、多肽链部分裂解成肽段、测定各个 肽段的氨基酸顺序、确定肽段在多肽链中的顺序、确定多肽链中二硫键的位置。 N-末端和C —末端AA残基的鉴定 二硫桥的断裂：氧化法（过甲酸）和还原法（疏基乙醇和DTT） o 多肽链的部分裂解：①酶裂解法 ②化学裂解法 二硫桥位置的确定：对角线电泳 6?蛋白质的四个结构层次 重点是超二级结构、结构域。 超二级结构：由两个以上二级结构单元相互聚集形成的有规则的二级结构的组合体如a a . P a B、PPP; 结构域（domain）, 乂称motif（模块、基序）。在二级结构及超二级结构的基础上，多肽链进一步卷 曲折叠，组装成几个相对独立、近似球形的三维实体。结构域是球状蛋白的折叠单位，多肽链折叠 的最后一步是结构域间的缔合。结构域间的裂缝，常是活性部位，也是反应物的出入口。一般情况 下，酶的活性部位位于两个结构域的裂缝中。 锌指：DNA结合蛋白中，2个His、2个Cys结合一个Zn 亮氨酸拉链：DNA结合蛋白中，由亮氨酸倒链形成的拉链式结构， 7?稳定蛋白质三维结构的力 非共价键：1、氢键是维持蛋白质三维结构的主要作用力。2、疏水作用（爛效应）在驱动蛋白 质的折叠方面占有突出的地位。 共价键：1、肽键2、二硫键：对蛋白质的三维结构起到稳定作用，有些二硫键对于维持活性 是必需的，有些是非必需的。绝大多数情况下，二硫键是在多肽链的B转角附近形成的。二硫键 主要存在于分泌到细胞外的蛋白质中，如核糖核酸酶和胰岛素等。 8.二级结构的元件 a螺旋及其特征：①多肽链上连续出现带同种电荷基团的氨基酸残基，（如Lys,或Asp,或Glu）, 则由于静电排斥，不能形成链内氢键，从而不能形成稳定的Q—螺旋。如多聚Lys、多聚Gku而当 这些残基分散存在时，不影响a —螺旋稳定。②Gly的①角和屮角可取较大范围，在肽中连续存 在时，使形成a—螺旋所需的二面角的机率很小，不易形成a—螺旋。丝心蛋白含50%Gly,不形成 a—螺旋。③R基大（如lie）不易形成a—螺旋。④Pro、脯氨酸中止Q—螺旋。⑤R基较小， 且不带电荷的氨基酸利于a —螺旋的形成。如多聚丙氨酸在pH7的水溶液中自发卷曲