16.2总论第III部-群体结构与选择理论-第十六章-分子标记与连锁图谱的制作2-连锁图谱制作.pdf

111 第十六章 分子标记与连锁图谱的制作 （续） 2 16-2 连锁图谱的制作 连锁图谱构建是重要农艺性状基因/QTL的标记和定位、基 因的图位克隆、比较作图以及分子标记辅助（MAS ）育种等 的基础。 连锁作图的原理与经典连锁测验的原理一致，即染色单体的交 换与重组。在细胞减数分裂时，非同源染色体上的基因相互 独立，自由组合；而位于同源染色体上的连锁基因在减数分 裂前期 Ⅰ因非姊妹染色单体间的交换而发生基因重组。 用重组率来表示基因间的遗传距离，图距单位用厘摩 （cM ）表 示，一个cM的大小大致符合1%的重组率。连锁图谱只显示 ，并不反映 。 基因间在染色体上的相对位置 DNA 的实际长度 连锁图谱构建的主要环节为： （1）根据遗传材料之间的多态性确定亲本组合，建立作图群体； （2）鉴定分离群体中不同个体的标记基因型； （3）借助计算机程序构建连锁群。 （1）建立作图群体 要构建好的连锁图谱，首先应选择合适的亲本及分离群体， 这直接关系到建立连锁图谱的难易程度、连锁图谱的准确性 及所建图谱的适用性。亲本间的差异不宜过大，否则会降低 后代的结实率及所建图谱的准确度。 而亲本间适度的差异范围因不同物种而异，通常多态性高的异 交作物可选择种内不同品种作杂交亲本，而多态性低的自交 作物则需选择不同种间或亚种间品种作杂交亲本。 如玉米的多态性极好，一般品种间配制的群体就可成为理想的分 子标记作图群体；而番茄的多态性较差，因而选用不同种间杂种 后代构建分子标记作图群体。 自花授粉作物或常异花授粉作物作图群体的构建方法见图16-6。 P1 × P2 F1 × P1 F1 × P2 F1 花培 F2 BC11F1 BC12 F1 DH F3 RIL 图16-6 自花或常异花授粉作物作图群体的构建方法 作图群体一般分为两类，一类为暂时性分离群体，包括F 群 2 体，BC F 等；另一类为永久性分离群体，包括重组自交系（ 1 1 RIL ）群体、加倍单倍体（doubled haploid，DH ）群体等。 它们的特点见表16-2。 表16-2 BC F 群体是由F 与亲本之一回交产生的群体。远缘杂交F 1 1 1 1 结实率低，构建的F 作图群体，易发生向两极疯狂分离，标 2 记比例易偏离3 ：1或1：2 ：1，这类种间杂交群体往往利用 BC F 群体。 1 1 RIL群体是由F 经多代自交一粒传（SSD ）方法获得的，基 2 因组相对纯合。RIL群体一旦建立，就可以代代繁衍保存， 有利于不同实验室的协同研究，而且作图的准确度更高。缺 点是建立RIL群体相当费时，而且有的物种很难产生RIL群 体。 DH群体是通过对F 进行花药离体培养或通过特殊技术 （如棉 1 花的半配生殖材料）得到单倍体植株，再经染色体加倍而获 得的纯合二倍体分离群体。因此DH群体