第1次_生物信息学研究生.pptVIP

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信息的特点 信息具有不灭性 信息可以廉价复制,可以广泛传播 信息的价值有很强烈的时效性 生物信息学是以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学 人类基因蓝图不是由孤立的基因和大量“垃圾DNA片段”组成的,而是一个复杂的网络系统,单个基因、调控元件以及与编码蛋白无关的其他类型的DNA序列一道,以交叠的方式相互作用,共同控制着人类的生理活动 . 参考书目 《基因的分子生物学:第7版》科学出版社 基因和基因组分析(第八版)科学出版社 基因7 / http://www.sanger.ac.uk/genetics/CGP/cosmic/ /tcga/ Tool-users Tool-makers bioinformatics public health informatics medical informatics infrastructure databases algorithms 三、后基因组时代的主攻方向 基因组相关信息的收集、储存、管理与提供 新基因的发现与鉴定 非编码区信息结构分析 生物进化的研究 完整基因组的比较研究 基因组信息分析的方法研究 大规模基因功能表达谱的分析 蛋白质分子空间结构的预测、模拟和分子设计 药物设计 对phox2b无遗漏分析寻找被忽略的非编码去的调控信息 五个服务器:AVID, MLAGAN, SLAGAN, phastCons, WebMCS phox2b is expressed in autonomic neurons during development phox2b 表达于后脑 phox2b 表达于后脑至延髓 phox2b 表达于延髓 phox2b 表达于肠神经系统 17个离散的DNA片段能使斑马鱼的特定细胞发光 Table 1. Quantitative analysis of multiple sequence alignment strategies “DNA元件百科全书”计划(Encyclopedia??of??DNA??Elements,简称ENCODE) 生物信息学的大科学特点 计算生物学家 实验生物学家 生物信息学的大科学特点 Bioinformatics 生物学 工程学 计算机软硬件技术 数学 书名:生物信息学与功能基因组学?? 作者:(美)乔纳森﹒佩夫斯纳|译者:孙之荣 出版社:化学工业出版社 出版日期:2006年6月?版次:1 ISBN:750258383?页数:706 开本:16开包装:平装 原价:¥95.0 ????????? 生物信息学(中文版) 作者: (美国)芒特著//钟扬 出版社:高等教育出版社 出版日期:2003-09 ISBN:704012187 原价:¥56.0 ??????? 生物信息学:序列与基因组分析-(第二版)(含光盘) 作者: 曾志伟 出版社:科学出版社 出版日期:2006-10 ISBN:703017640 原价:¥75.0 书名:生物信息学概论(北京大学生命科学译丛) 作者: T K Attwood D J Parry-Smith 罗静初 出版社:北京大学出版社 出版日期:2002-04 ISBN:730105468 原价:¥16.0 蔚蓝价:¥ 14.4 书名:生物信息学 - - 基因和蛋白质分析的实用指南 作者: AndreasD.Baxevanis/B.F.FrancisOuellette 出版社:清华大学出版社 出版日期:2000-08 ISBN:730203997 原价:¥39.0 * 超级电脑“尤金(Jugene)” 2008年2月22日,超级电脑“尤金(Jugene)”在德国西部小城尤利希(Juelich)的尤利希研究中心正式投入运行。尤金的运算功能相当于20000台普通PC,将主要用于欧盟的大型研究项目。 “尤金”是由IBM基于“蓝色基因 P”开发的新型运算平台,其浮点运算速度可达167万亿次每秒,相当于20000台现在普通PC的集合。当尤金全速运转时,最高峰值可以达到223万亿次每秒。 美国IBM的“蓝色基因”,位于Lawrence Livermore试验室,运算速度为478万亿次每秒,成为世界上最快的超型计算机,它有213,000颗处理器 美国IBM在超级计算机上仿佛吃了一剂强兴剂,猛的提高这么多... Two of the women who worked on ENIAC, Frances Bilas and Elizabeth Jennings with a portion of the giant which weighed 30 tons and had to be man

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