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《应用与环境生物学报》 Chin J Appl Environ Biol Doi: 10.19675/ki.1006-687x.2020.09003
收稿日期 Received: 2020-09-03 接受日期 Accepted: 2021-01-14
福建省重大农业科技专项(2015NZ0002-1)、福建省高原学科建设经费(102/71201801101)和福建农林大学科技创新专项基金(KFA19037A、CXZX2018076、KF2015108)资助 Supported by the Major Agricultural Science and Technology Project of Fujian Province (2015NZ0002-1), the Plateau Discipline Construction Fund of Fujian Province (102/71201801101) and the Science and Technology Innovation Special Fund Project of Fujian Agricultural and Forestry University (KFA19037A, CXZX2018076, KF2015108)
**通讯作者 Corresponding author (E-mail: Laizx01@163.com)
非洲菊SPFH基因家族鉴定及表达
李乾玉1 王秀美1 陈裕坤1 夏朝水2 叶 炜2 林玉玲1 赖钟雄1**
1福建农林大学园艺植物生物工程研究所 福州 350002
2三明市农业科学研究院 三明 365000
摘 要 SPFH(Stomain,Prohibitin,Flotillin and Hflk/C)超家族蛋白是锚定在膜微区的多样化膜蛋白家族,参与调控植物的生长发育、响应生物或非生物胁迫。基于非洲菊转录组数据,利用生物信息学对SPFH(GjSPFH)家族成员进行鉴定,分析其基本理化性质、亚细胞定位和保守氨基酸序列,构建系统进化树,并进行蛋白互作预测。利用转录组FPKM值分析GjSPFHs在非洲菊健康及感病时期的表达水平;利用荧光实时定量技术检测GjSPFH家族成员在不同组织(根、茎和叶片)和不同激素(SA和MeJA)处理下的表达模式。结果表明,非洲菊包含8个GjSPFH成员,其蛋白长度在285-393aa之间,蛋白理论分子量在31.22-43.14kD之间,等电点为5.53-9.80,其中有4个蛋白为稳定蛋白,4个为不稳定蛋白;均定位于线粒体,含有15个保守氨基酸序列; GjSPFH可分为3个亚组;该蛋白家族不仅成员之间可以发生互作,还与其他蛋白互作。非洲菊GjSPFH基因家族能够响应根腐病胁迫,GjPHB6在感病时期表达量显著高于健康时期,可能参与了与非洲菊抵御真菌侵染的过程。非洲菊GjSPFH基因的表达具有组织特异性,大部分GjSPFHs基因在叶片中表达量相对较高。GjSPFHs能够响应SA和MeJA的胁迫并呈现多种表达调控模式, 可能与非洲菊抗病性有关,但不同成员的功能有所差异。(图6 表3 参42)
关键词 非洲菊;SPFH基因家族;不同组织;激素;实时荧光定量PCR
Identification and expression analysis of SPFH gene family in Gerbera jamesonii
LI Qianyu1, WANG Xiumei1, CHEN Yukun1, XIA Chaoshui2, YE Wei2, LIN Yuling1, LAI Zhongxiong1**
1 Institute of Horticultural Biotechnology,Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China
2 Sanming Academy of Agricultural Sciences, Sanming 365000, China
Abstract SPFH(Stomain, Prohibitin, Flotillin and Hflk/C) superfamily proteins are diversified membrane protein families anchored in membrane microregions, and participated in the regulation of plant growth and development, and responded to biological and abiotic str
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