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生物学软件大全（精） 分子生物学软件介绍 目前，有很多软件可以解决分子生物学研究人员从立项到最 后写论文的实际问题。但由于软件的数目太多，而且各个软 件开发环境、运行平台和操作方法都各不相同——即使功能 的某些方面是相似的，这就给使用者造成了许多的不便。赛 百盛公司信息部在对相同作用的各类软件进行比较后，推荐 一些最实用软件给从事生物研究的工作人员 ] 一、实验准备阶段 这时一般要查一些与实验相关的文献以便对自己所要做的 课题的最新的进展有一个基本的了解，从而确定自己的实验 策略。推荐使用软件 Manager 9.0 可以在线通过查找搜索宋 体 ; Times New Romanlsquo;gt; 数据库中的专业资料 , 同时保存查找的资料为本地文件。资料内容和记录分上下两 个屏幕，如有全文或想连接网络时敲键盘就可以到相应的全 文文章和。可以直接在 WORD中查找资料，并插入引用。在 文章中对引用的文献可以格式化，引用的参考资料格式有很 强的用户自定义功能，可以符合各种杂志对引用格式的要 求，引用时不用多窗口切换。 同类软件： Endnote 3.1.2 也是一个在线专业资料查找系统 , 可以保存查找资料 , 并在文章中对引用格式化 . 二、 实验实施阶段 第 1 页 随着实验的进行，就必须对实验过程中的 DNA、RNA和蛋白 质的信息进行各种处理，包括限制酶分析、引物设计、同源 序列比较、质粒作图、结构域 (motif) 查找、 RNA二级结构预 测、蛋白二级结构分析、 三维结构显示等方面的内容。 1、 综合软件 推荐软件： Omiga 2.0 实际上，大部分对核酸蛋白的序列分析功能，在 Omiga 2.0 中都能找到 ; 而且界面非常友好。 Omiga 作为强大的蛋白质、 核酸分析软件， 它还兼有引物设计的功能。 主要功能： 编辑、 浏览、蛋白质或核酸序列，分析序列组成。用 Clustal. W 进行同源序列比较，发现同源区。实现了核酸序列与其互补 链之间的转化，序列的拷贝、删除、粘贴、置换以及转化为 RNA链， 以不同的读码框、 遗传密码标准翻译成蛋白质序列。 查找核酸限制性酶切位点、基元 (Motif) 及开放阅读框 (ORF) ，设计并评估 PCR、测序引物。查找蛋白质解蛋白位点 (Proteolytic Sites) 、基元、二级结构等。查寻结果可以 以图谱及表格的显示，表格设有多种分类显示形式。利用 Mange快捷键，用户可以向限制性内切酶、蛋白质或核酸基 元、开放阅读框及蛋白位点等数据库中添加或移去某些信 息。每一数据库中都设有多种查寻参数，可供选择使用。用 户也可以添加、编辑或自定义某些查寻参数。可从 MacVectorTM、Wisconsin PackageTM等数据库中输入或输出 序列。另外，该软件还提供了一个很有特色的类似于核酸限 第 2 页 制酶分析的蛋白分析，对蛋白进行有关的多肽酶处理后产生 多肽片段。 同类软件： DNASIS 2.5 。 DNASIS for Windows 2.5 版是日 立软件公司 (Hitachi Sofeware Engineering Co.,Ltd.)97 年推出的一个功能强大