现代微生物学与实验技术第一章绪论.pptx

现代微生物学与实验技术;参考资料：;第一章 绪论;分类;20世纪70年代以前，生物类群间的亲缘关系主要是根据形态结构、生理生化、行为习性等表型特征以及少量的化石资料来判断它们之间的亲缘关系。 要使分类系统真正成为总结生物进化历史的生物系谱， 需要系统的古生物资料来阐明各类生物之间的共祖、分支和年代关系。因此，在缺乏化石资料的情况下，最为艰难的任务是如何确定类群之间的进化关系，用什么特征作为划分类群的主要特征。 根据形态学特征推断生物之间的亲缘关系存在两个突出问题：一是由于微生物可利用的形态特征少，很难把所有生物放在同一水平上进行比较；二是形态特征在不同类群中进化速度差异很大，仅根据形态推断进化关系往往不准确。 ;因此，70年代以后研究微生物的系统发育，主要是分析和比较生物大分子的结构特征，特别是蛋白质、RNA和DNA这些反映生物基因组特征的分子序列，作为判断各类微生物乃至所有生物进化关系的主要指征。 大量研究表明：蛋白质、RNA和DNA序列进化变化的显著特点是进化速率相对恒定。因此，这些生物大分子被看作是分子计时器或进化钟，它们真实地记录了各种生物的进化过程。 我们可以通过比较不同类群的生物大分子序列的改变量来确定它们彼此系统发育相关性或进化距离。在两群生物中，如果同一种分子的序列差异很大时，表示它们进化距离远，这两群生物在进化过程中很早就分支了；如果两群生物同一来源的大分子的序列相同，说明它们处在同一进化水平上。; 挑选恰当的大分子应注意以下几点： (1)它必须普遍存在于所研究的各个生物类群中。 (2)选择在各种生物中功能同源的大分子。 (3)为了鉴定大分子序列的同源位置或同源区，要求所选择的分子序列必须能严格线性排列，以便进行进一步的分析比较。 (4)还应注意根据所比较的各类生物之间的进化距离来选择适当的分子序列。当我们比较亲缘关系远的生物类群时，必须选择变化速率低的分子序列,因为序列变化速率高的分子，在其进化过程中共同的序列已经丧失。;16SrRNA被普遍公认为是一把好的谱系分析的“分子尺”，这是因为： (1)rRNA??与生物蛋白质的合成过程，其功能是任何生物都必不可少的，而且在生物进化的漫长历程中，其功能保持不变； (2)在16SrRNA分子中，既含有高度保守的序列区域，又有中度保守和高度变化的序列区域，因而它适用于进化距离不同的各类生物亲缘关系的研究； (3)16SrRNA分子量大小适中，便于序列分析。5SrRNA信息量小，应用上受很大限制；23SrRNA分子量大，序列测定和分析比较工作量大，使用时难度较大； (4)16SrRNA普遍存在于真核生物和原核生物中(真核生物中其同源分子是18SrRNA)，因此它可以作为测量各类生物进化的工具——这一点极为重要 。 ;1981年美国学者伍斯等根据某些代表生物16SrRNA(或18SrRNA)序列比较，首次提出了一个函盖整个生命界的系统树，而后又进行了多次修改和补充。图为近年提出的一个全生命系统树 ：;;伍斯三界理论提出后，国际上对生物的系统发育进行了更广泛的研究，除了继续对rRNA序列进行比较外，还广泛研究了其他特征，包括许多表型特征。研究结果表明：三界理论虽然是根据16SrRNA序列的比较提出的，但其他特征的比较研究结果也在一定程度上支持了三界生物的划分。;据报导，古生菌--詹氏甲烷球菌(Methanococcus jannaschii)的全基因组序列测定结果及其通过计算机软件与少数真细菌和真核生物全基因组序列所进行的初步比较，其结果虽未显示出古生菌与真核生物较真细菌亲缘关系更近的结论，但也初步证实了它是独立于其他两域生物的第三生命形式。古生菌作为当今仍生活在地球上某些极端环境(高盐、低PH、高温、高压或极端缺氧环境)的一个特殊群体(上述产甲烷球菌就是生活在2600m深、200大气压、94℃左右的海底火山口附近)，其特殊的生境与地球生命起源初期的环境有许多相似之处。 三界学说的建立和发展，其主要意义并不在于目前研究所取得的某些结论，更重要的是它为进一步探讨生命起源和进化，进一步认识、研究和开发微生物资源提出了新的思路，它所提出的研究生物进化的技术方法使我们看到了揭开生命起源和进化之谜的曙光。 当然，随着研究的进一步深入，其学说也必然面临新的挑战 ;建立16 S r RNA系统发育树的意义;1.2 微生物学的分支学科;2. 微生物学的发展史;2.2 初创期（1676－1861年）;2.3 奠基期（1861－1897年）;科赫对新兴的医学微生物学作出了巨大贡献。 科赫首先论证炭疽杆菌是炭疽病的病原菌，接着又发现结核病和霍乱的病原细菌，并提倡采用消毒和杀菌方法防止这些疾病的传播； 他的学生们也陆续发现白喉、肺炎、破伤风、鼠疫等的病原细菌，导致了当时和以