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- 2021-07-18 发布于内蒙古
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蛋白质三级结构预测 swiss-model同源建模
蛋白质三级结构预测lpar;swiss-model同源建模rpar;
利用同源建模预测蛋白质的三级结构
首先声明一下,以下纯属个人观点,方法步骤仅供参考,不可作为规范标准,结果出来之后请自行分析结果。
我用的是SWISS-MODEL同源建模的方法进行的蛋白质高级结构预测,其实这个方法是有限制条件的,不过作为一个选修课作业,我们不用深入探究,所以有时不够严谨,大家知道就行!
对于一个未知结构的蛋白质,白质建立结构模型。
那么,我们首先要做的就是找到和我们
空格和“—”的氨基酸序列,例如:【字母大小写没有影响】vlqdsigyirilsmmdpvvdefdrayqqvkdfpdlmvdvrengggnsgngkkiceylihkpqphcvspdweiiprkd)同源的、相似度最高的、已知三级结构的蛋白质作为模版。 打开SWISS-MODEL网站:/,选择“Template Identification,提交蛋白质序列进行模板识别,如图所示,注意:邮箱必填,名称随便填写,序列粘贴过去就行,下面会有很多选项,建议不知道的不要乱动,直接提交(Sbumit)吧。
这个东东跟BLAST差不多,你等它自动刷新吧,它会返回结果的,在结果页面,你会看到跟BLAST差不多的结果,选择相
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