中心WRF使用指南.docx

中心WRF使用指南 1、 以下内容中hpc-user表ZF用户已开通的局性能帐号；login node表不不同分区登录节 点； 2、 在编译节点也可以提交任务； 3、 文件及文件夹命名方式仅供参考； 4、 在作业提交之前，建议使用者熟悉Linux操作的几个常用命令（例如：vi或vim、cd、 mkdir、Is、pwd 等）和 WRF 建模。 作业提交 ? 1、在电脑上用Xshell客户端（或其他类似软件）登陆高性能账号，若不知道自己的 高性能帐号在哪个分区，登陆帐号以后输入：pwd,可以看到如下图，home-后面的就 是高性能帐号所在的分区（图中为YW分区）： |nsyw21 l_LZGycn24 pwd /home-yw/i2sers/nsyw211 LZ ?2、如需直接提交作业,在高性能账号下创建放计算任务的文件夹test/run-12/wrf （该 名称可以根据自己习惯命名）： rnkdir -p test/run-12/wrf ? 3、用FTP工具登录高性能帐号，将计算所需的算例文件通过XFTP上传至账号目录 、test/run-12/wrf : vi wrf-4.0 YW.lsf vi wrf-4.0 YW.lsf D /test/wrf/run-12 名称 ； ETAMPNEWADATAADBL 5C iAGENPARM.TBL 261 B JljHLC.TBL J ki LAN DUSE.TBL 2$ JliMPTABLE.TBL ~l R.EADME.namelist 4e 14C R.EADME.rasm_diag README.tsI： st 、.RRTMG_LW_DATA 82E . 4、切换至Xshell界面，进入算例文件夹中：cd test/run-12/wrf ?5、创建或拷贝提交作业的脚本文件wrf-4.0_YW.lsf （也可在Windows系统写好以后用 FTP工具上传；现以YW分区直接从公共目录中拷贝为例），WRF软件脚本的路径 ^E/home-yw/soft/jobscripts/中。先查看脚本是否存在，图中wrf-4.0_YW.Isf即为所 需脚 本： [nsywl45_OLLi9ycn24 ~]$ Is /home-yiv/soft/jobscripts/ Gaussianfi9D91 VASP5.4.1 g romac s - 515_YW, Is f . MOLPRO cp2k-6.l_YW.lsf laranps -2018Ma rl6_YW. 1st |namd-2 ? 11_YW .Lsf qe-6.3_YVI .1st M5 gr omac s-2018.4 YW. Is f laranps ? 2019 Au gO7_YW. Is flnamd-2.12_YW.Isf wrf-4.5_*YWAsf [nsywl45_QLUgycn24 ?I [nwchera-6? _YW? Is f ?6、采用您最熟悉的方式将上述脚本拷贝至需要提交任务的文件夹中（注意cp后丿 前有空格）： nsyw21 l_LZ@ycn24 run-12]S cp /home-yw/soft/jobscripts/wrf-4 ? 0_YW.lsf ? /[ ?7、修改模板脚本: dos2unix wrf-4.0 YW.lsf dos2unix wrf-4.0 YW.lsf ? 输入字母*，进入编辑模式。脚本内容如下，部分内容需要根据况进行修 改： APP_NAME=intelY_mid为提交作业计算的队列，不同的分区、不同的核数所 使用的队列不相同，参见各分区提交作业脚本及队列说明； NP= 12为计算该作业设置的核数”可以根据任务的需要进行修改。除FN分区 外，其他分区每个节点12核（FN分区32核），需要跨节点并行时，建议使用12的 多倍值（新节点除外）O #!/bin/bash APP_NAME=intelY_mid NP=24 NP_PER_NODE= 12 RUN=”RAW “ CURDIR=$PWD source /home-yw/soft/envdir/wrf-4.0.sh mpiiun -np $NP ? 9、按下键盘上的esc键后，输入“q保存脚本文件，并退出。 ? 10、将脚本文件转换为UNIX格式（如从Windows系统上传的话必须要转换，不然 提交作业时会报错；若直接拷贝公共目录中的脚本，并在Linux环境中进行修改，则 可以省略步骤10、11。若提交作业的脚本名称不为wrf-4.0_YW.lsf，则需要修改为对 应的脚本名称）： 11、 赋予脚本文件可执行权限： chmod +x wrf-4.0_YW.lsf 12、 用bsub命令提交作业脚本: bsub wrf-4.0_