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- 2021-07-31 发布于广东
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人类后基因组时代新药研发 人类后基因组时代新药研发 7.生物信息学(Bioinformatics) 生物信息学需要处理指数扩增的海量基因 和蛋白质序列资料 摩尔定律 30 人类后基因组时代新药研发 核酸序列的生物信息学分析 结构域分析(基因组序列注释) 包括:启动子、转录因子结合序列、内含子、外 显子、重复序列、开放读码框架等。 同源分析和检索 包括:Nr数据库、EST数据库、Unigene数据库、 STS数据库、 Swissprot数据库、HTGS数据库等。 基因突变分析 包括:EST数据库,SNP数据库等 Data-mining 从基因数据库发掘重要的功能基因 31 人类后基因组时代新药研发 蛋白质一级结构分析 结构特点分析 包括:等电点、信号肽、穿膜区、DNA结合序列等 同源分析和检索 包括:Nr数据库、Swissprot 数据库等 功能区分析 包括:Prosite、Emotif、Identify分析等。 32 人类后基因组时代新药研发 蛋白质空间结构分析 蛋白质晶体结构数据库检索,如PDB数据库。 蛋白质空间结构预测,如Homology等软件分析 33 人类后基因组时代新药研发 人类功能基因研究的二级数据库要求 提供未知功能的靶基因cDNA、基因组DNA、编码区蛋白质序列,应有EST序列的支持。 提供蛋白质一级结构信息数据,包括等电点、穿膜区、核定位信号、DNA结合域、功能区、特殊结构分析结果等 提供核酸和蛋白质序列同源性分析的结果(应定期更新) 提供外显子、内含子、启动子等基因组结构的图谱 提供表达谱分析 34 人类后基因组时代新药研发 cDNA序列 Nr数据库 EST数据库 HGP数据库 Unigen 数据库 SNP数据库 同源序列 检索 序列拼接; 新剪切体 分析 基因组序列 结构 表达谱 分析 基因变异 cDNA序列的数据库分析 35 人类后基因组时代新药研发 8. 蛋白质组学(Proteomics) 研究细胞或组织的基因组表达的全部蛋白质(表达蛋白质组学,Expression proteomics) 通过细胞内蛋白质复合物研究蛋白质与蛋白质的相互作用(细胞作图蛋白质组学,Cell-map proteomics) 双相电泳技术和质谱技术是蛋白质组学研究的最重要技术 36 人类后基因组时代新药研发 37 人类后基因组时代新药研发 蛋白质2D电泳分析 38 人类后基因组时代新药研发 9. 结构基因组学 高通量的蛋白质三维结构分析,为蛋白质的功能研究和药物设计提供基础 39 人类后基因组时代新药研发 10. 模式生物和病原生物基因组学 对其它生物进行全基因组序列分析,开展比较基因组学(comparative genomics)研究。迄今至少已有 5 种真核生物,38种微生物完成全基因组序列分析 40 人类后基因组时代新药研发 人类后基因组时代新药研发 人类后基因组时代新药研发 人类后基因组时代(Post-genome era) 人类后基因组时代新药研发 基本概念 基因(Gene):生物体的遗传单位,由脱氧核糖核酸(DNA)组成。DNA由4种核苷酸(A、T、 C、G)组成。 1 人类后基因组时代新药研发 人类基因组的23对染色体 2 人类后基因组时代新药研发 从DNA到蛋白质 3 人类后基因组时代新药研发 From DNA to Human 4 人类后基因组时代新药研发 2000年是基因组之年,完成了人类基因组的工作框架图,完成了一系列模式生物和微生物的基因组 序列分析。 5 人类后基因组时代新药研发 我国94年启动“中华民族基因组若干位点基因研究”“重大疾病相关基因研究”课题,99年承担了人类基因组1%序列的测序任务,负责第3号染色体3千万核苷酸的序列测定工作。 6 人类后基因组时代新药研发 人类后基因组时代的特点 人类首次了解了自身的基因序列,了解了很多远亲生物的基因序列 人类正在面对指数扩增的基因序列资料和各种数据库 人类面临的挑战是如何将基因序列资料转变为有用的知识,进而让这些知识服务于人类,使之能够造福于人类的健康。 7 人类后基因组时代新药研发 前基因组时代的“钓鱼”和后基因组时代的“捞鱼” 8 人类后基因组时代新药研发 后基因组时代研究的重要方向 1.单基因遗传病的致病基因研究和基因诊断 我国有丰富的疾病资源,特别是一些我国特有的单基因遗传病家系,可提供良好的基础发现新的致病基因. 9 人类后基因组时代新药研发 单基因遗传病和复杂疾病 10 人类后基因组时代新药研发 在复杂性疾病的中,由于基因的变异加环境和生活习惯等因素的共同影响,使得每个人对不同的疾病的易感
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