生物信息检索方法.pptxVIP

生物信息学Bioinformatics;2;三、序列数据信息检索实例;问题一：这是什么基因？ 问题二：编码的蛋白质序列是怎样的？ 问题三：有没有保守的功能结构域 ？ 问题四：它的功能是怎样的？ 问题五：它在真核生物中保守吗？ 问题六：有没有三级结构信息？ 问题七：和哪些蛋白有相互作用？ 问题八：不同组织中基因表达特异性是怎样的？ 问题九：该基因启动子序列是什么？是否受到某些转录因子的特异性调节？ 问题十：是否受到某些小RNA的调节？ ;问题一：这是什么基因？;;提交序列;Blast结??? ;D10Wsu52e;Gene?info:?10号染色体;相关文献;功能注释：Gene?Ontology;结论一：核酸序列;问题二： 编码的蛋白质序列是怎样的？;15;获取FASTA序列;结论二：氨基酸序列;问题三：  有没有保守的功能结构域 ？;查询保守结构域;输入序列号NP_663397;结论三：保守结构域;问题四：它的功能是怎样的？;UniProt:?蛋白质数据库;在哺乳类数据库中做BLAST搜索;Q99LF4;蛋白质信息;功能注释;28;结论四：功能分析;问题五：它在真核生物中保守吗？;/blast/;;Chordata Mammalia - mammals (15 transcripts, 13 species) Actinopterygii - bon