检测新型冠状病毒变异株和亚型的方法发明专利.pdfVIP

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 113215164 A (43)申请公布日 2021.08.06 (21)申请号 202110686862.4 (22)申请日 2021.06.21 (71)申请人 南方医科大学 地址 510515 广东省广州市白云区沙太南 路1023号-1063号 (72)发明人 唐时幸　梁源浩　赵建辉　王海鹰　 (74)专利代理机构 北京科亿知识产权代理事务 所(普通合伙) 11350 代理人 赵蕊红 (51)Int.Cl. C12N 15/113 (2010.01) C12N 15/11 (2006.01) C12Q 1/70 (2006.01) C12Q 1/6816 (2018.01) C12R 1/93 (2006.01) 权利要求书2页 说明书14页 序列表9页 附图6页 (54)发明名称 检测新型冠状病毒变异株和亚型的方法 (57)摘要 一种基于CRISPR‑Cas12a法检测新型冠状病 毒SARS‑CoV‑2变异株的特异crRNA、探针、检测体 系及方法，用于鉴别L亚型和S亚型的特异crRNA 为Orf8‑crRNA，用于鉴别SARS‑CoV‑2的S蛋白基 因的变异位点L5F、D80A、D215G、R246I、Y453F、 N501Y、A570D、D614G、A701V、T716I、S982A、 P1263L、K417N、L452R、E484Q的特异crRNA分别为 S‑L5F‑crRNA、S‑D80A‑crRNA、S‑D215G‑crRNA、S‑ R246I‑crRNA、S‑Y453F‑crRNA、S‑N501Y‑crRNA、 S‑A570D ‑crRNA、S‑D614G ‑crRNA、S‑A701V ‑ crRNA、S‑T716I ‑crRNA、S‑S982A‑crRNA、S‑ P1263L‑crRNA、S‑K417N‑crRNA、S‑L452R‑crRNA、 A S‑E484Q‑crRNA。探针的核苷酸序列为SEQ  ID  4 NO.14。检测体系包括crRNA、探针、无核酶水以及 6 1 5 缓冲液buffer2.1。可以准确地检测出SARS‑CoV‑ 1 2 3 2变异株，不需要依赖昂贵的仪器和专业的技术 1 1 N 人员，检测时间短，具有高特异性、高灵敏度、快 C 速高效、操作简便、结果易读等优点。 CN 113215164 A 权　利　要　求　书 1/2页 1.一种用于鉴别新型冠状病毒SARS‑CoV‑2不同变异株核酸的特异crRNA，基于CRISPR‑ Cas12a技术检测，其特征在于， 用于鉴别L亚型和S亚型的特异crRNA为Orf8‑crRNA，核苷酸序列为5’‑UAAUUUCUACUAA GUGUAGACCUUUUACAAUUAAUUGCCA‑3’(SEQ  ID NO  1)； 用于鉴别SARS‑CoV‑2的S蛋白基因的变异位点L5F、D80A、D215G、R246I、Y453F、N501Y、 A570D、D614G、A701V、T716I、S982A、P1263L、K417N、L452R、E484Q的特异crRNA分别为S‑L5F‑ crRNA、S‑D80A‑crRNA、S‑D215G‑crRNA、S‑R246I‑crRNA、S‑Y453F‑crRNA、S‑N501Y‑crRNA、S‑ A570D‑crRNA、S‑D614G‑crRNA、S‑A701V‑crRNA、S‑