遗传图谱的构建方法和装置发明专利 (1).pdfVIP

遗传图谱的构建方法和装置发明专利 (1).pdf

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(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利 (10)授权公告号 CN 105368923 B (45)授权公告日 2018.09.14 (21)申请号 201410428174.8 C12M 1/00(2006.01) C12M 1/34(2006.01) (22)申请日 2014.08.27 (56)对比文件 (65)同一申请的已公布的文献号 申请公布号 CN 105368923 A EP 1783646 A1,2007.05.09, CN 103617256 A,2014.03.05, (43)申请公布日 2016.03.02 CN 102952855 A,2013.03.06, (73)专利权人 深圳华大基因科技服务有限公司 审查员 吕小蒙 地址 518083 广东省深圳市盐田区北山工 业区综合楼科技创业园201 (72)发明人 刘三阳 简建波 韩雪莲 刘娜  方晓东  (74)专利代理机构 北京清亦华知识产权代理事 务所(普通合伙) 11201 代理人 张大威 (51)Int.Cl. C12Q 1/6869(2018.01) 权利要求书2页 说明书10页 附图3页 (54)发明名称 遗传图谱的构建方法和装置 (57)摘要 本发明公开了一种遗传图谱的构建方法和 装置,该方法包括:接收分子标记数据和多个个 体的测序数据;根据分子标记数据对多个个体的 测序数据进行整合得到预设格式的第一基因型 数据;根据第一基因型数据获取每个标记的标记 缺失率、每个个体的个体标记缺失率和任意两个 标记之间的物理距离中的一种或多种;根据标记 缺失率、个体标记缺失率和任意两个标记之间的 物理距离中的一种或多种对个体和/或标记进行 筛选,以得到第二基因型数据;根据第二基因型 数据构建遗传图谱。本发明实施例的遗传图谱的 构建方法,免去人工操作,省时省力,并且提高了 B 整理和筛选的准确率和效率,从而提高了构建遗 3 传图谱的准确性和效率,为遗传图谱的构建提供 2 9 8 了便利的条件。 6 3 5 0 1 N C CN 105368923 B 权 利 要 求 书 1/2页 1.一种遗传图谱的构建方法,其特征在于,包括: 接收分子标记数据和多个个体的测序数据; 根据所述分子标记数据对所述多个个体的测序数据进行整合得到预设格式的第一基 因型数据; 根据所述第一基因型数据获取每个标记的标记缺失率、每个个体的个体标记缺失率和 任意两个标记之间的物理距离中的一种或多种; 根据所述标记缺失率、所述个体标记缺失率和所述任意两个标记之间的物理距离中的 一种或多种对个体和/或标记进行筛选,以得到第二基因型数据; 根据所述第二基因型数据构建遗传图谱; 其中,根据所述标记缺失率、所述个体标记缺失率和所述任意两个标记之间的物理距 离中的一种或多种对个体和/或标记进行筛选,以得到第二基因型数据包括以下操作中的 任意一种或一种以上: 获

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