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R中的统计模型
R 中的统计模型 这一部分假定读者已经对统计方法,特别是回归分析和方差分析有一定的了解。后面我们还会假定读者对广义线性模型和非线性模型也有所了解。R 已经很好地定义了统计模型拟合中的一些前提条件,因此我们能构建出一些通用的方法以用于各种问题。R 提供了一系列紧密联系的统计模型拟合的工具,使得拟合工作变得简单。正如我们在绪论中提到的一样,基本的屏幕输出是简洁的,因此用户需要调用一些辅助函数来提取细节的结果信息。 1定义统计模型的公式 下面统计模型的模板是一个基于独立的方差齐性数据的线性模型 ∑=+=p j i ij j i e x y 0β ),0(~2σN I D e i 用矩阵术语表示,它可以写成 e X y +=β 其中y 是响应向量,X 是模型矩阵(model matrix )或者设计矩阵(design ma- trix )。X 的列p x x x ,...,,10是决定变量(determining variable )。通常, 0x 列都是1,用来定义截距(intercept )项。 例子 在给予正式的定义前,举一些的例子可能更容易了解全貌。 假定y ,x,x 0,x 1,x 2,...是数值变量,X 是一个矩阵,而A,B,C,...是因子。下 面的例子中,左边给出公式,右边给出该公式的统计模型的描述。 y~x y~1+x 二者都反映了y 对x 的简单线性模型。第一个公式包含 了一个隐式的截距项,而第二个则是一个显式的截距 项。 y~0+x y~-1+x y~x-1 y 对x 过原点的简单线性模型(也就是说,没有截距项)。 log(y)~x 1+x 2 y 的变换形式log(y)对x 1和x 2进行的多重回归(有一个隐 式的截距项)。 y~poly(x,2) y~1+x+I(x^2) y 对x 的二次多项式回归。第一种是正交多项式 (orthogonal polynomial ),第二种则显式地注明各项的 幂次。 y~X+poly(x,2) y 利用模型矩阵X 和二次多项式项x 进行多重回归。 y~A y 的单因素方差分析模型,类别由A 决定。 y~A+x y 的单因素协方差分析模型,类别由A 决定,协方差项 为x 。 y~A*B y~A+B+A:B y~B%in%A y~A/B y对A和B的非可加两因子方差分析模型(two factor non-additive model)。前两个公式表示相同的交叉分类 设计(crossed classification),后两个公式表示相同的嵌 套分类设计(nested classification)。抽象一点说,这四个 公式指明同一个模型子空间。 y~(A+B+C)^2 y~A*B*C-A:B:C 三因子实验。该模型包括一个主效应(main effects)和 两个因子的交互效应(interactions)。这两个公式等价。y~A*x y~A/x y~A/(1+x)-1 在A的各个水平独立拟合y对x的简单线性回归。三 个公式的编码不一样。最后一个公式会对A各个水平 分别估计截距项和斜率项的。 y~A*B+Error(C) 一个实验设计有两个处理因素A和B以及因子C决定 的误差分层(error strata)。如在裂区实验设计(split plotexperiment)中,所有区组(还包括子区组)都由 因子C决定的。 操作符~用来定义R的模型公式(model formula)。一个普通的线性模型式可以表示为 response~op 1 term 1 op 2 term 2 op 3 term 3... 其中response是一个作为响应变量的向量或者矩阵,或者是一个值为向量/矩阵的表达式。op i是一个操作符。它要么是+要么是-,分别表示在一个模型中加入或者去掉某一项(公式第一项的操作符可选)。term i可以(1)是一个向量,矩阵表达式或者1,(2)因子,(3)是一个由因子,向量或矩阵通过公式操作符连接产生的公式表达式(formula expression)。 基本
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