蛋白质结构与功能预测.pptVIP

Picture View 其他数据库中的AC号 保守区示意图 ID名 第四十九页，共77页。 InterPro蛋白家族信息 AC号，家族名称 家族蛋白 其他数据库中的收录情况 相关的其他家族 条目类型 第五十页，共77页。 InterPro蛋白家族信息 生物体内的信息 说明 结构链接 数据库链接 第五十一页，共77页。 InterPro蛋白家族信息 该家族蛋白在不同种类生物体中出现情况 其他家族与该家族的重叠情况 第五十二页，共77页。 * 练习四：InterProScan http://www.ebi.ac.uk/InterProScan/ 数据：C:\ZCNI\shixi4\protein.txt 第五十三页，共77页。 * 五、蛋白质三维结构预测 方法 特点 工具 同源建模法 ( Homology/Comparative modelling ) 基于序列同源比对，对于序列相似度30％的序列模拟比较有效，最常用的方法 SWISS-MODEL， CPHmodels 串线法/折叠识别法 (Threading/Fold recognition) “穿”入已知的各种蛋白质折叠骨架内，适于对蛋白质核心结构进行预测，计算量大 THREADER，3D-PSSM 从头预测法 ( Ab initio/De novo methods ) 基于分子动力学，寻找能量最低的构象，计算量大，只能