蛋白质结构与功能预测.ppt

蛋白质结构与功能预测;实习一;DNA sequence;蛋白质序列分析;蛋白质结构预测过程;ExPASy（Expert Protein Analysis System）Tools（/tools/）;一、蛋白质理化性质分析 使用工具：Protparam 二、跨膜区分析 使用工具：Tmpred 三、二级结构分析 使用工具：PredictProtein Server 四、结构域分析 使用工具：InterProScan 五、蛋白质三级结构分析 使用工具：SWISS-MODEL/SWISS-PdbViewer 数据： C:\ZCNI\shixi4\protein.txt ;一、蛋白质基本理化性质分析 ;工具;AACompIdent ;Protparam;主要选项/参数;输入Swiss-Prot/TrEMBL AC号—分不同的功能域肽段 ;返回结果;;;练习一：Protparam;(a)-Type I membrane protein (b)-Type II membrane protein (c)-Multipass transmembrane proteins (d)-Lipid chain-anchored membrane proteins (e)-GPI-anchored membrane proteins;α螺旋跨膜区主要是由20-30个疏水性氨基酸（Leu、Ile、Val、Met