第十章转座ppt表面等离子共振技术在相互作用研究中的应.pptxVIP

第十章 转座;;1 概念： 转座子（transponson,简称Tn）, 又称易位子，是指存在于染色体DNA上可以自主复制和位移的一段DNA顺序。 转座子可以在不同复制子之间转移，以非正常重组方式从一个位点插入到另外一个位点，对新位点基因的结构与表达产生多种遗传效应。 ; 1951年McClintock-麦克林托克提出转座（Transposition）和跳跃基因(jumping gene)的新概念； 1967年Shapiro才在E.coli中发现了转座因子（transposable element）。 ;第二节 转座子的分类;;;表 复合转座子的结构和功能;;;1 类型;2 转座的机制2.1 复制性???座:;2.2 非复制型转座 断裂和重接反应使靶重构。 供体保持裂缺。 不形成共合体。 ;3 Tn10的转座-转座频率的调控 每个转座子控制自身转座的核心----控制转座酶的水平 不到一个转座酶分子／世代／细胞 自发转座频率---10－7 Tn10有两种控制转座的方式 ; a） 通过反义RNA的翻译水平控制; b） 甲基化作用控制转座酶合成及其与DNA的结合;4 转座作用的遗传效应;;第四节 真核生物的转座因子;表 一些有代表性的真核转座子的属性;1玉米中的控制因子 ;;1.2 玉米中控制因子家族;玉米中控制因子家族是由一个单一类型的自主元件和许多不同的非自主元件组成。 已经发现的玉米中的转座因子包括： Ac-Ds, Spm-dSpm 等。 玉米转座因子的特点和原核的转座因子相似。 在其两端有反向重复序列（IR），在与靶DNA连接处有短的正向重复（DR）。;在Ds-Ac系统中， AC: 大部分自主因子AC中含5个外显子的单个基因，其产物是转座酶， 末端11bp的IR和8bp的DR，DR是由靶位点重复而成。 Ds: 各种Ds因子的长度和序列都不相同，但和Ac相关。其末端同样有11bp的IR。 Ds比Ac短，其缺失的长度不同，一个极端的例子是Ds9因子仅缺失194bp，另一个例子是Ds6因子长仅有2Kb，相当于Ac两端各1kb。;2．果蝇中的转座子---P因子 “杂种不育”（hybrid dysgenesis）。 P型（父本贡献的，paternal contributing） M型（母本贡献的，maternal contributing） P（♂）×M（♀） 后代不育 M（♂）×P（♀） 后代可育。 ;;P元件;发生机制;没有P因子 没有阻遏物;;1．反转录病毒 1.1 概念 转座：从DNA到DNA的转移； 反转座：从DNA到RNA再到DNA的转移过程。 反转录转座子/反转座子：一些真核细胞的转座子和反转录病毒的原病毒的一般组成结构相关，并且通过RNA中间体进行转座。;1.2 反转录病毒的生活史;1.3 反转录病毒基因组的结构与功能;;反转录病毒线型DNA的末端是LTRs,整合到宿主DNA中时，两端各丢失了2 bp;2 反转录病毒的整合模型 2.1 反转录病毒RNA转变为病毒线性DNA 反转录病毒被称为正链病毒，这是由于病毒的RNA本身编码蛋白产物。 反转酶负责将基因变成为互补的DNA链，这链称为负链DNA（minus strand DNA）。双链中的第二条DNA单链称为正链DNA（plus strand DNA）。 反转酶: 具有DNA聚活酶的活性，还具有RNase H的活性，可以降解RNA-DNA杂种链中的RNA部分。 ;在反转录中通过模板转换产生负链DNA;正链DNA的合成需要第二次跳跃 ;模板的转换和延伸的结果是将U3序列加到5’端，同时也将U5加到了3’端，使两端产生了相同的序列。 这种序列结构“U3-R-U5”被称为长的末端重复序列（long terminal repeat ，LTR）； US的3’端和U3的5’端由一个短的IR组成的，因此LTR本身的两个末端都有反向重复序列，而它的侧翼是靶DNA形成短的正向重复序列。 整合的原病毒DNA像是转座子：前病毒末端的反向重复序列，其两侧面有靶DNA的正向重复序列。 ;2.2 反转录病毒DNA的整合到宿主细胞基因组 原病毒是通过将线性DNA正向插入到靶位点中产生的，由病毒的整合酶所催化。 ;反转录病毒整合入宿主DNA中的分子机制，本质是转座； 整合的病毒DNA两端的LTR各丢失了2bp 而它的侧翼是靶DNA形成短的正向重复序列;反转座子共有的可鉴定的特性为：插入位点会产生短的靶序列的正向重复。 反转录病毒首先被观察到的是以传染性病毒颗粒的形式存在，并能在细胞间传播； 而反转座子是被当作基因组中的一部分而被发现的，它们可以在基因组内进行转座，但不能在细胞间迁移。;3 反转座子的分类 病毒超