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- 2021-10-31 发布于江苏
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实验二 质粒的酶切和琼脂糖凝胶电泳(diàn yǒnɡ)检测;实验二 质粒的酶切和
琼脂糖凝胶电泳检测
实验目的
实验原理
实验仪器、材料与试剂
实验步骤
实验结果(jiē guǒ)及讨论 ;一、实验(shíyàn)目的 ;二、实验(shíyàn)原理 ;琼脂糖凝胶电泳(diàn yǒnɡ)对DNA分子的检测,主要基于在凝胶中加入溴化乙锭,这样溴化乙锭分子就会嵌入DNA分子中形成络合物,使DNA在紫外光下发射很强的荧光,而在紫外光下DNA发出的荧光是可见光。在溴化乙锭足够的情况下,荧光的强度正比于DNA的含量,因而DNA的检测很方便。如将已知大小和浓度的标准样品(Marker)作电泳(diàn yǒnɡ)对照,就可估计出待测样品的大小和浓度。;三、实验仪器、材料(cáiliào)与试剂 ;材料
实验一中提取(tíqǔ)的质粒DNA和本实验酶切后的质粒DNA。
试剂
1. 限制性内切酶 EcoR I,HindIII(XholI)
2. 50×TAE电泳缓冲液(pH8.0):
Tris 242g
冰醋酸 57.1ml
0.5mol/L EDTA(pH8.0) 100ml
稀释到电泳缓冲液1×TAE
;3. 溴化乙锭溶液(róngyè) :10mg/ml水溶液(róngyè),室温,棕色瓶或铝铂纸包装保存。
4. 10×(6×) ×DNA样品上样缓冲液 (Loading Buffer,溴酚蓝指示剂, DNA样品加样缓冲液)
5. 琼脂糖Agarose;四、 实验步骤(bùzhòu)
在20μL反应体系中,包括:
质粒KS 16 μL
EcoR I 1μL
Xhol I 1 μL
Buffer H 2μL
ddH2O 0μL
37℃酶切1.5~2.0 小时。 ;或在20μL反应(fǎnyìng)体系中,包括:
质粒pMD18-T 16 μL
EcoR I 1μL
HindIII 1 μL
Buffer M 2μL
ddH2O 0μL
37℃酶切1.5~2.0 小时。 ;注:双酶切体系。最初我们 PCR使用(shǐyòng)的PMD18-T(KS)载体特点:600bp外源基因片段的两端分别被EcoR I 和HindIII(Xho I) 酶切,插入PMD18-T(KS )载体MCS多克隆位点,因而可进行EcoR I 和HindIII(Xho I)双酶切验证。双酶切得到的小的外源片段大小应是600bp左右。; pMD18-T Vector;;pBC SK map
;琼脂糖凝胶制备(zhìbèi)步骤;5.待Agrose琼脂糖凝胶液稍凉(约55℃左右,不烫手)后,加入 约1/1000的1 mg/ml溴化乙锭溶液(约4 μL至终浓度为0.5-1 μg/ml)后轻轻混匀,倒入制胶槽上,勿起气泡(避免剧烈摇晃产生气泡);
6. 室温下约30分钟后,琼脂糖溶液完全凝固,小心(xiǎo xīn)垂直拔出梳子和挡板,清除碎胶,将凝胶放入电泳槽中;
7. 加入电泳缓冲液(1×TAE)至电泳槽中,使液面高于胶面约1mm;
8. 在DNA样品中加入2μL (1/10体积)的10× DNA上样缓冲液(loading buffer),混匀,稍甩一下,使溶液都处于离心管底; ;使用(shǐyòng)3 mg的DNA Marker DL 2,000(500 ng/条带)进行1%的琼脂糖凝胶电泳后,各DNA条带自上至下分别为2kb,1Kb,750bp,500bp,250bp,100bp。;9. 用移液器吸起离心管中溶液,移入凝胶的梳孔中;
10.插上导线,打开电泳仪电源,按照需要调节电压至100V,电泳开始,观察电流情况或电泳槽中负极的铂金丝是否有气泡出现(chūxiàn);
11.等溴酚蓝泳动至凝胶前沿后,将电压(或电流)回零,关闭电源,停止电泳;
12.取出凝胶,在紫外观测仪上观察电泳结果;
13.根据需要切下DNA条带,放入1.5ml Ep管中,放于4℃保存,以备下周实验用。
;五、实验(shíyàn)结果及讨论;;;;;内容(nèiróng)总结
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