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为什么说基因组学是生命科学的前沿学科?
基因组学已成为生命科学的前沿学科, 已渗透到各个科学领域, 出现了结构基因组学, 功
能基因组学,蛋白组学,功能蛋白组学,功能酶学,生物信息学,生物计算机,药物基因
组学,疾病基因组学等基因研究方向。
1、启动子: 细菌中 RNA 聚合酶结合并启动转录的 DNA 序列。
2 、转录因子: 是转录起始过程中 RNA 聚合酶所需的辅助因子。
3 、RNA 聚合酶: 是能够特异性地与启动子结合并启动转录的蛋白质。
4 、转录因子( transcription factor ,TF ):是转录起始过程中 RNA 聚合酶所需的辅助因子。按功能可
分为两类: 1.普遍性转录因子( general transcription factor )是转录起始复合物的组成成员,将 RNA 聚
合酶定位在核心启动子上。 2.激活转录因子:对转录起始复合物的组装及转录速率施加影响,决定某
一基因是否表达。
5 、RNA 编辑( RNA editing ):改变原有 mRNA 碱基序列组成的修饰。有两种方式:
①将 mRNA 分子中某些碱基进行代换,使原有 mRNA 密码子的含义发生改变
②在 mRNA 分子内部插入某些核苷酸,使 mRNA 原有的读码框发生大范围的改变
6 、转录物组( transcriptome ):基因组在整个生命过程中所表达的全部转录物的总和。
7 、翻译( translation ):按照 mRNA 密码子的排列顺序在核糖体上依次连接对应氨基酸合成多肽链的
过程。
8 、密码子摆动性( wobble ) :密码子的第 3 个碱基选择不同碱基配对的现象。出现的原因:反密码子
位于环化的 tRNA 序列内,是反密码子的第一个核苷酸与密码子第三个核苷酸不能形成标准的碱基配
对。
9 、密码子 (codon):mRNA 分子中每相邻的三个核苷酸编成一组, 在蛋白质合成时, 代表一种氨基酸。
61 个氨基酸密码子, 3 个终止密码子。
10、移码( frame shift ):如果翻译时出现反密码子与正密码子的配对间断或重叠,将改变后续的编码
信息,这一现象称为移码。
11、滑移( slippage): 当核糖体到达一系列密码子的末端时,它释放出刚合成的蛋白质,滑动到下一
个起始密码子,并开始下一个蛋白质的合成。
12、翻译跳跃: 转录物的很大一部分,可能几十个碱基对被跳过,跳跃之后继续原来蛋白质的延伸。
跳跃的开始和终止发生于两个相同密码子或因摆动而由同一 tRNA 翻译的两个密码子之间。
13、转位( translocation )核糖体移动三个核苷酸,使二肽 -tRNA 从 A 位点移至 P 位点,从而导致 A
位点空出,新的氨酰 -tRNA 进入。
14、分子伴素( chaperonin )是原核生物和真核生物中一类称为蛋白质的折叠体— GroEL/ GroES 复合
物。
15、序列间隙( sequence gap):指测序时遗漏的序列,这些序列仍然保留在尚未挑选到的克隆中。可
从基因组文库中进一步筛选遗漏的克隆予以封闭。
16、物理间隙 (physical gap):指构建基因组文库时被丢失的 DNA 序列。 要封闭此类间隙, 就需要采
用不同的载体或宿主菌构建第二个克隆文库来加以解决。
17、基因组注释( Genome annotation ):就是要鉴定基因组中全部的结构和功能元件,并且将这些信
息在基因组水平上进行集成和展示。基因组注释的内容主要包括:基因识别和基因功能注释。识别基
因的生物信息学方法主要有:从头预测( ab initio )根据基因的序列特征,运用有效的算法和计算机程
序预测基因。同源性搜索( Homology Search )通过相似性比对从数据库中的已知基因和蛋白质序列来
预测基因。比较基因组学( Comparative Genomics )运用同线性预测基因。
18、基因打靶 是通过同源重组将外源 DNA 定点整合入靶细胞基因组上某一确定的位点,以达到定点
修饰改造染色体上某一基因的技术。
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