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【实验(shíyàn)目的】 了解:琼脂糖凝胶电泳的原理(yuánlǐ)。 掌握:琼脂糖凝胶的制作及电泳的方法。 第二十八页,共56页。 【实验(shíyàn)原理】 琼脂糖是由琼脂分离制备的链状多糖,溶解后链间的糖分子上的羟基由于氢键的作用相互连接,形成三维空间结构,构成(gòuchéng)大网孔型凝胶。随着琼脂糖浓度的不同形成不同孔径的凝胶,用于分离、纯化相对分子质量大小不同的DNA分子。 DNA分子在pH高于其等电点的溶液中带有负电荷,在处于电场的琼脂糖凝胶中向正极泳动。不同的DNA分子在同一电场中的电泳速率不同,从而达到分离的目的。 第二十九页,共56页。 【实验(shíyàn)原理】 荧光(yíngguāng)嵌入燃料如溴化乙锭分子嵌入DNA分子中形成络合物,由于溴化乙锭在紫外光照射下能发射荧光(yíngguāng),从而在紫外线下直接观察DNA条带在凝胶中的位置。 第三十页,共56页。 【试剂(shìjì)与器材】 低熔点琼脂糖(约65℃熔化 ) 5×TBE电泳(diàn yǒnɡ)缓冲液 溴化乙锭(EB) 稳压稳流电泳(diàn yǒnɡ)仪 水平电泳(diàn yǒnɡ)槽及点样梳 溶液Ⅳ(加样缓冲液) 第三十一页,共56页。 【实验(shíyàn)步骤】 1.配制0.7%低熔点琼脂糖溶液; 2.冷却至55℃左右,加入EB(0.5ug/mL),摇动混匀; 3.用胶带围封电泳板两端,平置,插好点样梳,将温热的琼脂糖溶液倒入电泳板中,冷却后放4℃冰箱(bīngxiāng)10-20min; 4.拔出梳子,撕去胶带,将电泳板放入电泳槽中,加入0.5×TBE电泳缓冲液500mL; 5.加5uL溶液Ⅳ于DNA样品管中,混匀,取20uL混合液加入加样孔中(潜水式加样); 6.盖上电泳槽盖,接好电源线,打开电源开关,以1-5V/cm电压电泳, 7.在紫外分析仪的玻璃平板上观察电泳结果。 第三十二页,共56页。 注意事项 1、应在琼脂糖应完全融化后制胶,倒胶时要避免产生气泡,若有气泡要用吸管吸去; 2、EB为强诱变剂,有致癌作用; 3、加样孔容积决定最大加样量,切忌加样孔中样品(yàngpǐn)过多而溢出; 4、采用低电压、长时间电泳,可以得到分辨率较好、带型整齐的电泳图谱。 第三十三页,共56页。 实验(shíyàn)四DNA片段的回收与重组连接 第三十四页,共56页。 【实验(shíyàn)目的】 了解:DNA片段(piàn duàn)的回收与重组连接的原理。 掌握:从琼脂糖凝胶中回收DNA片段(piàn duàn)的方法及 DNA重组连接技术。 第三十五页,共56页。 【实验(shíyàn)原理】 DNA片段的回收: 质粒、噬菌体等经酶切后,DNA片段需要纯化(chún huà)。常将酶切产物电泳后,从凝胶中将合适大小的DNA片段进行回收和纯化(chún huà)。 第三十六页,共56页。 【实验(shíyàn)原理】 DNA的重组连接: 在Mg2+和ATP存在下,T4-DNA连接酶能催化(cuī huà)载体分子的粘性末端与外源DNA的相同粘性末端联接成重组DNA分子。 联接反应的影响因素包括温度、时间、酶量、缓冲系统、DNA末端的性质级浓度、DNA片段的大小等。 第三十七页,共56页。 【试剂(shìjì)与器材】 紫外分析仪 T4DNA连接酶 第三十八页,共56页。 DNA片段的回收: 1.在紫外灯下,从凝胶中切下含有待回收DNA的胶条,大小片段分开放(kāifàng)置于EP管中,65℃孵育5min,捣碎; 2.加入300uL TE液,摇匀; 3.用DNA分离纯化的方法沉淀DNA。 DNA的重组连接: 1.10uL的反应体系中依次加入:目的DNA(小片段)3uL;载体(大片段)1uL;蒸馏水4uL;10×Buffer 1uL; T4DNA连接酶 1uL 2.用封口膜封口,混匀,12000r/min离心2min,16℃反应过夜。 【实验(shíyàn)步骤】 第三十九页,共56页。 注意事项 1.紫外灯下切(xià qiē)下待回收DNA的凝胶时,应尽量减小含目的DNA片段胶块的体积,切割时间不超过30S; 2.紫外灯下切(xià qiē)下待回收DNA凝胶时,防止外源DNA的污染; 3.为保证目的DNA片段装载到载体上,最好目的DNA片段的分子数/载体分子数﹥3; 4.连接酶的最佳反应温度是16℃。 第四十页,共56页。 质粒DNA的分离纯化 加等体积氯仿(振荡混匀),12000rpm 5min, 上层水相转至新EP管,重复一次 ? 加1/10体积3mol/L NaAc和2.5倍体积无水乙醇(充分 混匀),-20℃ 10min,12000rpm 10min,弃上清
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