生化学第11章rna的生物合成.pptx

第11章;在生物界，RNA合成有两种方式：;转录 (transcription) 是生物体以DNA为模板合成RNA的过程 。 ;转录的知识是理解许多生物学现象和医学问题所必需的。 对于RNA生物过程的调节可以导致蛋白质合成速率的改变，以及由此而引发的一系列代谢变化， 因此，了解RNA代谢的基本原理就甚为重要。这些原理既关系到所有生物是如何适应环境变化的，也关系到细胞结构和功能的分化机制。 ;复制和转录的相同点;复制和转录的区别;一、 RNA转录合成的特点; ;结构基因(structure gene)： DNA分子中能转录出RNA的区段。;;DNA双链中按碱基配对规律能指引转录生成RNA的一股单链，称为模板链(template strand)，也称作有意义链或Watson链。相对的另一股单链是编码链(coding strand)，也称为反义链或Crick链。 ;5′···GCAGTACATGTC ···3′;RNA转录合成时，以DNA作为模板，在RNA聚合酶的催化下，连续合成一段RNA链，各条RNA链之间无需再进行连接。;RNA转录合成时，只能向一个方向进行聚合，所依赖的模板DNA链的方向为3→5，而RNA链的合成方向为5→3。 ;RNA转录合成时，只能以DNA分子中的某一段作为模板，故存在特定的起始位点和特定的终止位点。 特定起始点和特定终止点之间的DNA链构成一个转录单位，通常由转录区和有关的调控序列构成。 ;原料: NTP (ATP, UTP, GTP, CTP) 模板: DNA 酶 : RNA聚合酶(RNA polymerase, RNA-pol) 其他蛋白质因子;这是一种不同于引物酶的依赖DNA的RNA聚合酶。 RNA合成的化学机制与DNA聚合酶催化DNA合成相似。;DNA聚合酶在启动DNA链延长时需要引物存在，而RNA聚合酶不需要引物就能直接启动RNA链的延长。 RNA聚合酶和DNA的特殊序列——启动子(promoter)结合后，就能启动RNA合成。 ;原核生物中的RNA聚合酶全酶由五个亚基构成，即?2???。 ?亚基与转录起始点的识别有关，在转录合成开始后被释放；余下的部分（?2??）被称为核心酶，与RNA链的聚合有关。 ;核心酶 (core enzyme);利福平可通过与?亚基以共价键结合，阻止第一个NTP的进入，抑制RNA合成的起始。;原核生物有多种σ因子 一般情况下起作用的是---σ70 σ70 有四个保守区域： 第2区域、第4区域和-35区和-10区结合;三、RNA聚合酶结合到DNA的启动子上起动转录;位于结构基因上游，与RNA聚合酶识别、结合并起始转录有关的一些DNA调控序列被称为启动子（promoter)。 调控序列中的启动子是控制转录的关键部位，由σ亚基辨认启动子，其他亚基相互配合。 启动子序列通常由一些带共性的保守序列构成。 对启动子的研究，常采用一种巧妙的方法即RNA聚合酶保护法。;RNA聚合酶保护法;;原核生物转录起始区的一致性序列; 被RNA聚合酶辨认的区段就是位于转录起始点-35区的TTGACA序列。 酶与该区结合后，即滑动至-10区的TATAAT序列（Pribnow盒） ，并启动转录。;RNA聚合酶全酶在转录起始区的结合:;原核生物的转录过程 The Process of Transcription in Prokaryote;RNA聚合酶必须准确地结合在转录模板的起始区域。 DNA双链解开，使其中的一条链作为转录的模板。;E.coli的转录起始和延长 ;2. DNA双链局部解开，形成开放转录复合体(open transcription complex) ；;σ亚基辨认-35区;第一个磷酸二酯键生成后，σ亚基即从转录起始复合物上脱落，核心酶连同四磷酸二核苷酸，继续结合于DNA模板上，酶沿DNA链前移，进入延长阶段。 ;二、 原核生物的转录延长时蛋白质的翻译也同时进行;转录空泡(transcription bubble)：;;转录延长：;;依赖Rho 因子的转录终止 非依赖Rho因子的转录终止;ρ因子是由相同亚基组成的六聚体蛋白质，亚基分子量46kD。 ρ因子能结合RNA，又以对poly C的结合力最强。 ρ因子还有ATP酶活性和解螺旋酶(helicase)的活性。;ρ因子的作用原理：;目前认为，ρ因子终止转录的作用是：与RNA转录产物结合，结合后ρ因子和RNA聚合酶都可发生构象变化，从而使RNA聚合酶停顿，解螺旋酶的活性使DNA/RNA杂化双链拆离，利于产物从转录复合物中释放 。;（二） 非依赖 Rho因子的转录终止;5`UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU... 3` ;茎环结构使转录终