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基于Cannon方法的矩阵相乘mpi编程
问题描述:
矩阵A, B 均为N*N的方阵,试计算矩阵C=A*B;使用P个进程并行计算(N可以被P整除);矩阵A,B及C均采用分布式存储,采用Cannon、Fox、Systolic或DNS算法;编写计算C矩阵的MPI程序,并进行计算。实际计算时, 矩阵A, B请采用如下值:
要求:计算出C矩阵后,请计算,并由根节点打印出来。
将S值与串行程序的结果进行对比,校验程序的正确性;
分别N值设为100,200,500,并分别用1,2,4,10个进程进行计算,并利用MPI_Wtime( )函数计算程序的运行时间,考核不同N值和不同进程数下的程序可观测加速比。
Cannon方法原理说明
图 SEQ 图 \* ARABIC 1 分块与进程Cannon方法要求进程数p是完全平方数。如下图,先将A、B、C分成的方阵块,,,对应储存在进程(i,j=0,1,……)中。然后按下面的算法原理写程序即可。
图 SEQ 图 \* ARABIC 1 分块与进程
Cannon算法原理很简单,主要分四步:
所有块Aij向左循环移动i步;所有块Bij向上循环移动j步;
所有处理器Pij执行Aij和Bij的乘加运算;
所有Aij向左循环移动1步;所有Bij向上循环移动1步;
转②执行 次。
图 SEQ 图 \* ARABIC
图 SEQ 图 \* ARABIC 2 执行步骤①
图
图 SEQ 图 \* ARABIC 3 执行步骤③和④
图 SEQ 图 \* ARABIC 4 执行步骤②
详细算法如下:
输入: ,
输出:
Begin
对所有处理器myid(myid=0,……p-1)同时执行如下算法:
计算子块行号i=myid/m,j=myid%m;(其中m=sqrt(p));
for k=0 to m-1 do
if(ik)then LeftMoveOneStep();
if(jk)then UpMoveOneStep();
end for
for k=0 to L-1 do //(L=N/m为子块维度)
for l=0 to L-1 do
C[k*L+j]=0
end for
end for
for s=0 to m-1 do
for k=0 to L-1 do
for l=0 to L-1 do
for t=0 to L-1 do
C[k*L+l]+=A[k*L+t]*B[t*L+l];
end for
end for
end for
LeftMoveOneStep();
UpMoveOneStep();
end for
End
函数LeftMoveOneStep()算法:
Begin
① 将所存的A子块发给Id_Move(i,j-1,m)进程的bufferA;
② 从Id_Move(I,j+1,m)进程接收bufferA,复制到本进程的A。
End
函数UpMoveOneStep()算法:
Begin
①将所存的B子块发给Id_Move(i-1,j,m)进程的bufferB;
②从Id_Move(i+1,j,m)进程接收bufferB,复制到本进程的B。
End
函数Id_Move(i,j,m)算法:
return [(i+m)%m]*m+(j+m)%m即可。
程序源代码
先给出串行代码,增强对矩阵相乘的理解,从而降低编程难度;不仅可用于检验并行程序结果,还可比较并行效率。
//运行模式为./name 500.500为矩阵大小。
#includestdio.h
#includestdlib.h
#includemath.h
#includetime.h
int main(int argc,char *argv[])
{
int i,j,k,N;
clock_t tstart,tend;
double *x,*y,**A,**B,**C,C2_sum=0,ttotal,*tmp1,*tmp2,*tmp3,*tmp4;//定义tmp1-4是因为初始化A和B时,tmp们只需计算一次。
tstart=clock();
N=atoi(argv[1]);
x=(double *)malloc(N*sizeof(double));
y=(double *)malloc(N*sizeof(double));
A=(double **)malloc(N*sizeof(double **)*N);
B=(double **)malloc(N*sizeof(double **)*N);
C=(double **)malloc(N*sizeof(double **)*N);
tmp1=(double *)malloc(N*sizeof(double));
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