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- 2022-07-17 发布于重庆
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第三十一页,共五十四页。 生命现象的众多层次 系统生物学、生物复杂性、生态系统 生物多样性、种群动力学 动物行为科学 个体、器官、组织 细胞及其通信、信号传导 免疫网络、调控网络、代谢网络 复制、转录、剪接、翻译、运输 生物大分子: 蛋白质与核酸(DNA、RNA) 小分子(糖、脂肪、核苷酸、氨基酸)、金属离子、水 分子和原子的相互作用 第三十二页,共五十四页。 来自我们工作的几个具体例子 完全基因组中的缺失和稀少字串:相关的组合学和语言学问题 籼稻基因组框架图:测序读出大量短串的拼接、重复序列带来的困难、长DNA链中寻找基因 细菌亲缘关系和分类学 第三十三页,共五十四页。 细菌完全基因组中的缺失和稀少短核苷酸串 以大肠杆菌为例: 一个DNA环:4 639 221 个a,c,g,t字母 长度为8的短串共有种65536种 同长随机序列中平均每种串出现71次 实际情形如何? 第三十四页,共五十四页。 seeDNA程序演示 C语言 + Xlib + Xtoolkit UNIX或LINUX平台 由GenBank取得基因组数据 背后的组合学和语言学问题 第三十五页,共五十四页。 第三十六页,共五十四页。 第三十七页,共五十四页。 第三十八页,共五十四页。 从学科交叉漫谈生物信息学 第一页,共五十四页。 科学、宗教与艺术 同源而殊途:同
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