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MRIcro 使用说明(人工翻译版)
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MRIcro
系统
win95 或者随后的Linux 系统
需求 x86,或 SUN 微系统的 x86 (我觉得这不
是问题,支持 32 位的就行)
硬件 支持 16 或 24 位色的
当前版本 1.40 build 1(这说明书有点老叻)
费用 免费
作者 Chris Rorden 描述:
把医疗图像转化为SPM 友好分析格式。(SPM,即 Scanning Probe Microscopy,扫描探针显微)。
可以逐次分析查看分析格式的图像。 创建分析格式的头文件。
创建 3D 兴趣区域(通过计算容量和密度)
兴趣区域的多层叠加。
旋转图像来符合SPM 的模版图像。
输出图像格式包括BMP,JPEG,PNG,TIF。
结合图像:多个图像的相关查看。(观察相同坐标的 PET 或 MRI
扫描)
介绍
MRIcro 允许在装有 windows 和 Linux 系统的电脑上浏览医疗图 像。这是一个单机运行的程序,这他包裹郑重补充 SPM 的工具。MRIcro 可以有效率的浏览和输出脑图像。除此之外,它还能使神经生理学家
鉴定有意义的区域。MRIcro 可以创建给其他平台输出脑图像的分析 格式的头文件。
对其他 Windows 程序熟悉的使用者将发现这个软件非常简单好 用。把鼠标停在按钮上一段时间将在这个按钮上出现一个文字暗示。 万不得已,我们还揍了一个简要的使用手册来描述基本的功能。
加载图像和主信息面板
MRIcro 可以浏览各种各样的图像格式,包括 SPM 分析格式。分 析格式的图像包括两个部分:一个是包括原始图像资料的 img 格式文 件和一个描述图像维度的 hdr 格式的文件。MRIcor 的住信息面板显 示了头文件的信息和一系列的按钮这样你就可以打开浏览头文件。
Open Analyze format hdr/img pair 这个按钮是你能有留言
Analyze 或者NIfTI 格式的图像。当你按下这个按钮的时候,一个是 你选择头文件去打开的对话会出现。MRIcro 这时候就会试图打开一 个邮箱头名字的图像文件。
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图 1 主要信息面板。
Show extended header information 这个按钮可以打开一个窗 口来显示当前打开的头文件的信息。
slice 浏览面板
slice 浏览面板是你可以选择加载映像文件的表象。滑动选择要 显示的片。(你可以在滑动条右边的编辑框编辑,或者请按 Fn1/Fn2
来观察连续的上一个或者下一slice,也可以用鼠标的滚轮来切换, 如果有的话~~)。
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图 2 slice 浏览面板 当你浏览轴向面、横断面和冠状面视图的
时候,你通过独立地调整三个编辑框可以设置X,Y,Z 三个坐标。
改变图像亮度和控制对比度值的按钮在 sun 这个按钮旁边和反
对比图像。这些数值描述了窗口的中心和窗口显示的宽度。窗口中心
(window centre)指的是显示中等灰度的图像强度,同时窗口的宽 度描述的范围在亮白和完全黑色之间。点击“auto contrast”(显 示是以一个黑色箭头指向一个有缺口的白圈)设置图像的 1%为完全 的黑或完全的白。自动平衡工作对 MRI 扫描来说很好用,但是对 CT 扫描来说通常不太好用,这时骨头显示的比背景和脑组织都要亮。对 CT 扫描来说,你可以通过在“View”窗口选择一个“Contrast Preset[CT]”来做一个好的设置。例如,“Bone”这个预设置把窗口 中心设置在 400 到 2000 之间(这样相对合理一些),这通常对 CT 扫 描中发亮的骨是有效的。
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图 3 你可以通过按住鼠标右键把需要调节对比度的区域从图像
中框出来,来调节这个区域的对比度。亮度值(窗口中心)和对比度 值(窗口宽度)的调节与选区是成比例的。注意:如果你选择了任何
兴趣区的绘图工具,这个就不管用(按下快捷键Fn10 来取消)。
图 4 这个柱状图从侧面显示了这个名为“IconT1”图像的图像
强度。用户也可以自定义兴趣区域来创建条形图(看 ROI 部分详细介 绍)。注意:Mn 临界值列出,这个可以用来设置目标图像的图像强度 比例来匹配一个SPM 模版(详细请见指南部分)。
Histogram 这个按钮(在面板的左侧底部)显示立体像素在当前 打开图像的亮度分布。(见上图)
滑动条上面显示的六个图标可以让你选择图像的展现方式:轴 向,矢状,冠状,和投射(前面三个同时),自由旋转,多层面,三 维渲染。如果这个图像跟选择的按钮不匹配,图像也就不会保存为轴 向格式。在投射视图中,三个编辑栏显示在 slice 浏览区的靠上位
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