基于ImageJ软件的水稻根毛长度测量（农学毕业论文资料）.docVIP

基于ImageJ软件的水稻根毛长度测量（农学毕业论文资料） 目录 TOC \o 1-9 \h \z \u 目录 1 正文 1 文1：基于ImageJ软件的水稻根毛长度测量 1 文2：数字图像处理理论教学中应用ImageJ软件进行演示 7 一、数字图像处理课程教学所选用软件的现状分析 7 二、ImageJ软件概述 8 三、ImageJ软件在数字图像处理课程教学中的应用 9 四、结论 11 参考文摘引言： 12 原创性声明（模板） 12 文章致谢（模板） 13 正文 基于ImageJ软件的水稻根毛长度测量（农学毕业论文资料） 文1：基于ImageJ软件的水稻根毛长度测量 DOI:/-.049 水稻是单子叶植物的模式植物，也是重要的粮食作物。目前对于水稻地下部分的研究相对薄弱。根系是植物吸收外界水分、养分的主要器官，环境条件和栽培措施大多是首先通过影响根系的发育，进而影响到植株地上部分的生长。根毛是根的成熟区表皮细胞的细长突起。大部分被子植物的表皮细胞分为生毛细胞（Ｈ细胞）和非生毛细胞（Ｎ细胞）。以前一直认为水稻根毛是由表皮细胞不对称分裂后形成小的子细胞分化产生的，但近期的研究表明水稻根的表皮细胞是对称分裂的，根毛发达后生毛细胞比非生毛细胞的扩增速率快，导致根毛成熟时生毛细胞比非生毛细胞要小。生毛细胞比非生毛细胞的扩增速率快可能与生毛细胞是重要的吸收水分和营养的器官有关［１］ Ｉｍａｇｅ Ｊ是由美国国立卫生研究院（Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ）开发的一个基于ＪＡＶＡ的图像处理软件，可以显示、编辑、分析、处理多种图片格式，由于其操作简单有效已经广泛地应用于各个领域［２－４］。本研究利用Ｉｍａｇｅ Ｊ软件首次建立了水稻根毛长度的测量方法，使准确、简便地量化水稻根毛的长度成为可能；利用所建立的根毛测量方法对两组肉眼所见根毛长度无明显差异的水稻品种进行测量，发现此种方法可以揭示出不同水稻品种间根毛长度的差异，从而证明了该测量体系的可行性和有效性，为进一步研究水稻根毛发育及其影响因素打下了量化分析基础。 １ 材料与方法 １．１ 材料 水稻：中旱５号（ＺＨ５）、珍汕９７（ＺＳ９７），由华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室提供。 １．２ 方法 １）１／２ ＭＳ培养基配制。培养基配方为：２．２ ｇ ＭＳ粉末、１０ ｇ蔗糖、０．５ ｇ ＭＥＳ（2-（N-吗啡啉）乙磺酸）、１０ ｇ琼脂，去离子水定容至１ Ｌ。调节ｐＨ至５．８，高温高压灭菌１５ ｍｉｎ后倒入 １３ ｃｍ×１３ ｃｍ透明的塑料方形培养皿中，凝固后备用。 ２）种子灭菌及幼苗生长。将去掉颖壳的水稻种子分装在锥形瓶中，加入适量７５％（Ｖ／Ｖ）的乙醇摇晃１ ｍｉｎ，弃去乙醇，加入０．１５％（m∶V）升汞摇晃１５ ｍｉｎ，弃去升汞，最后用灭菌水清洗３～５次。将灭过菌的水稻种子横向（胚背向培养基一侧）摆放在１／２ ＭＳ培养基上，每皿１０粒。将培养皿封口后竖直向后倾斜１５°～２０°放置，使根能贴在培养基表面生长。２８ ℃光／暗（１６ ｈ／８ ｈ）培养或 ２８ ℃暗培养２ ｄ或３ ｄ。 ２ 结果与分析 ２．１ 水稻根毛的图像采集 去掉水稻幼苗培养皿封口膜后背面朝上，用体视显微镜（Ｌｅｉｃａ Ｓ８ ＡＰＯ；ＣＣＤ：ＤＦＣ２９０）拍照，参数设置为：１×、曝光４４０．３、饱和度０．８５、伽玛１．８４、增益１．８４×。 ２．２ 水稻根毛的测量 启动Ｉｍａｇｅ Ｊ软件，选择Ｆｉｌｅ→Ｏｐｅｎ（图１Ａ）打开所拍摄的水稻主根的体视镜图片；Ａｎａｌｙｚｅ→Ｓｅｔ Ｍｅａｓｕｒｅｍｅｎｔｓ（图１Ｅ）确定标尺；选择Ｒｅｃｔａｎｇｕｌａｒ Ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ工具（图１Ｂ），默认设置，将所需测量的部位选定，按键盘上的“Ｃｔｒｌ＋Ｃ”键，将所选区域复制，Ｆｉｌｅ→Ｎｅｗ→Ｉｎｔｅｒｎａｌ Ｃｌｉｐｂｏａｒｄ，所复制的区域会作为一个独立的窗口出现；用Ｆｒｅｅｈａｎｄ工具，默认设置，将主根选中（图１Ｃ），选择Ａｎａｌｙｚｅ→Ｍｅａｓｕｒｅ（图１Ｄ）得到主根的面积；选择Ｉｍａｇｅ→Ｔｙｐｅ→８－ｂｉｔ（图１Ｆ）将图像调整为灰度模式；选择Ｉｍａｇｅ→Ａｄｊｕｓｔ→Ｔｈｒｅｓｈｏｌｄ（图１Ｇ）通过拖动标杆（图１Ｈ）将根毛和主根选中，然后选择Ａｐｐｌｙ，选择Ａｎａｌｙｚｅ→Ａｎａｌｙｚｅ Ｐａｒｔｉｃｌｅｓ（图１Ｉ）会弹出一个设置框，调整Ｓｉｚｅ（ｐｉｘｅｌ〈２）→１，Ｓｈｏｗ→Ｏｕｔｌｉｎｅｓ→ＯＫ，这时会输出根毛和主根的面积和（图１Ｊ）。根据公式：根毛的平均长度＝（根毛和主根的面积和－主根的面积）／（２×所选区域的长度），得到根毛的平均长度。 ２．３ 水稻根毛测量方法的优化 以ＺＨ５和ＺＳ９７为材料，选取尖端（从距根毛起始处１ ｍｍ开始向上４