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高通量测序 应用
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高通量测序的用途
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高通量测序的用途
基因组序列的物种进行重测序,鉴定SNP,indel及基因组结构变化;对含有全基因组序列且转录本注释较好的物种开展转录组学研究,解析细胞转录产物的数量变化及其结构信息。
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高通量测序现状
第二代测序技术,又称超高通量测序。目前,科学家正为1000美元完成一个基因组测序而努力。多家研究单位正在为此展开竞争,而且进展比预期的更快。
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高通量测序原理
高通量测序方法原理示意图
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高通量测序平台
高通量测序的三大平台:
Illumina公司的Solexa测序仪 ,
罗氏公司(Roche)的454 测序仪 ,
ABI公司的SOLiD 测序仪
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高通量测序特点
速度快
通量高
结果一致性好
简便高效
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高通量测序在基因组上应用
应用于人基因组重测序
动植物、细菌基因组测序
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高通量测序在mRNA表达谱的应用
将miRNA的标记与线性放大相结合,只需要几皮克纯化的miRNA就能获得高敏感度的miRNA芯片表达谱。
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高通量测序在microRNA中的应用
高通量、低成本
易于寻找新片段及作用位点
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高通量测序在CHIP-CHIP的应用
相对ref seq,染色质免疫沉淀以后的DNA直接进行测序, 可以直接获得蛋白与DNA结合的位点信息
相对ChIP-chip, ChIP-seq可以检测更小的结合区段、未知的结合位点、结合位点 。
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高通量测序在甲基化的应用
对于DNA甲基化的检测,目前采用:甲基化DNA富集并结合高通量测序 ,可以检测到全基因组范围内的甲基化现象。
特点:高效,准确
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特异片段测序
血浆DNA测序
游离RNA测序
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未来----高通量测序会成为临床辅助工具
致病基因
碱基突变
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Thank you !
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