《核酸结合蛋白》.ppt

编辑课件 蛋白 来源 指 结合的DNA 靶 功能 TFⅢA 哺乳动物 9 50bp 5S基因 5S基因转录因子 SP1 哺乳动物 3 10bp GC box 一般的转录因子 ADR1 酵母 2 22bp ADH2基因 激活ADH基因 Kruppel 果蝇 5 ? ？ 胚的分节 驼背基因产物 果蝇 4+2 ? ？ 胚的分节 带有Cis/Hi锌指结构的转录因子和DNA结合蛋白 ADR1:酿酒酵母的转录激活蛋白，表达醇脱氢酶ADH2等所需的DNA结合蛋白 典型的锌指蛋白有一组锌指，单个的锌指的保守序列是：Cys-X2-4-Cys-X3-Phe-X5-Leu-X2-His-X2-His,根据锌结合位点的氨基酸又把锌指分成为2Cys/2His和2cys/2cys两类，前者为Ⅰ型，后者为Ⅱ型锌指，Ⅰ型结构“指”的本身由23aa组成，“指”与“指”之间通常由7-8aa连接。 锌指可形成?- ?-helix插入大沟，与其相连接的?- sheet 在另一侧 糖皮质激素和雌激素受体都有两个“指”，每个指在Cys四分体的中央带有一个锌原子。两个指形成α-螺旋，彼此折叠成一个大的球状功能域。α-螺旋与螺旋相连的β折叠一道形成一个疏水中心。N-端螺旋的一侧和DNA的大沟接触，两个糖皮质激素受体形成二聚体和DNA结合，每个受体负责和连续的大沟接触。每个“指”控制着受体的重要特点。图表明在第一个“指”的右侧控制DNA的结合，在第二指的左侧控制着形成二聚体的能力。 View of the Lac repressor DNA complex, as determined by X-ray crystallography. Here the repressor tetramer is shown binding to two operators. Each dimer binds to one operator. The operators are 21 base pairs long here and are shown in dark and light blue. The monomers are colored green, pink, red, and yellow. Note how the amino-terminal headpiece on one monomer (pink) crosses the other monomer (green) to bind the first part of the operator, whereas the second monomer headpiece (green) crosses over to bind the second part of the operator. Thus, the recognition helix from each of two subunits binds to the consecutive parts of the same operator. 爪蟾TFШA锌指结构域 经典的锌指结构 三、半胱氨酸锌指 1、结构特点：含锌的DNA结合结构域只用半胱氨酸配位锌 2、核受体家族的DNA结合结构 （1）DNA结合结构为一个包含两相互垂直α螺旋的球形结构 （2）以二聚体的形式结合DNA 3、锌双核簇：酵母蛋白所特有，由6个半胱氨酸配位2个锌原 子，具有保守序列C-X2-C-X6-C-X6-C-X2-C-X6-C 表 Cys2/Cys2型的调节蛋白 蛋白 大小 指 靶 糖皮质激素受体 94,000 2 GRE中20bp 雌激素受体 66,000 2 ERE中20bp GAL4(酵母) 99,000 1 UAS中17bp 腺病毒E1A ～30,000 1 ? 糖皮质激素受体-DNA复合物 GAL-4的锌双合簇的结构（左：前视图；中：测视图 右：俯视图（拉链作为二聚化结构） 四、碱性结合结构域（bZIP及bHLH) 亮氨酸拉链（Leucine ziipper）和螺旋-环-螺旋（HLH） 1、结构特点：高度碱性的α螺旋作为同DNA的基本识别结构， 螺旋通常以二聚体的形式存在，二聚化结构域一样为DNA 结合所必需。 2、结合机制：碱性结构域在溶液中采用一种无序的部分螺 旋结构，当同DNA结合时，这种结构发生了变化而诱导了 典型α螺旋的形成。 C-Jun和C-Fos蛋白的异二聚体的结合比它们同二聚体更为坚固。Myc，C/EBP（结合CAAT box和SV