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群体遗传学知识点归纳
I.群体基本概念
群体:同一物种生活在某一地区内的、能够相互交配的个体群
群体遗传学:研究群体中基因的分布及逐代传递中维持和改变基因频率、基因型频率的因素
基因库(gene pool): 一个群体所具有的全部遗传信息
基因频率:某一等位基因占该基因座位全部等位基因的比率
基因型频率:某一基因型的所有个体在所研究群体中所占的比例,由基因型频率推算等位基因频率。
群体的遗传结构:基因库中各种基因的频率,以及由不同交配类型所带来的各种基因型在数量上的分布
观察基因型:携带相同罕见基因型个体的表型有何不同
基因型对应于某种表型:疾病状态、治疗效应、不利事件的可能性
群体遗传学调查的核心问题:群体的基因频率为何变化,决定因素有哪些,这些因素怎样作用于群体并导致群体基因频率发生变化。
Hardy- Weinberg遗传平衡定律
Hardy- Weinberg遗传平衡定律
?符合条件:大群体;随即婚配;无自然选择;无新生突变;无大规模迁移。(实际不存在)
?群体中的基因频率和基因型频率在世代传递中保持不变
,数学表达式:(p q)2,即 p2(AA) 2pq(Aa) q2(aa)=l
各类基因型频率推广式:(pl p2 p3……pn)2
基因的遗传机制本身并不影响群体中遗传变异保持的平衡机制,奠定现代群体遗传学最重要的理论基础
Hardy- Weinberg 定律的理解
基因型频率是随着基因频率的变化而变化的,群体平衡的标志是基因型频率保持不变
基因频率变化了,基因型频率一定会随之变化
基因频率不变,基因型频率也可能变化
基因型频率若保持不变,基因频率一定不会变化
如果一个群体的基因频率和基因型频率在世代间保持不变,这个群体就被称为平衡群体。
虽然显性基因的作用可以掩盖隐性基因的作用,但是隐性变异不会因此而逐渐消失
基因多杰性:人类基因组广泛多态性使不同基因座等位基因存在多种组合,导致群体的高度遗传多样性和个体的遗传独特性。
纯合度:二pi2;杂合度:1-S pi2 ; pi为第i个等位基因的频率
(如某个等位基因具有很高的频率,而其它接近于零,杂合度将降低;如所有等位基因都具有相同的频率,则该座位上群体的杂合度达到最大)
3.应用
(1)隐性等位基因频率的估计
对于罕见的隐性遗传性状,q20. 0001, p^l,群体中杂合携带者的数量2Pq远远多于纯合受累个体的数量q2。随着疾病发病率的降低,杂合子/纯合子的比率升高。
(2) HWE吻合度检验
按照HWE定律,比较由各基因随机组合获得各种基因型频率的预期值与实际观察值。可以估计群体调查资料的可靠性,包括基因频率估计的可靠性和精确性。
x 2 =£ (观察值-期望值)2/期望值;df=基因型数目-等位基因数目
P2 0.05作为无显著性差异的界限
III.影响群体遗传结构的因素
(1)突变(mutation)
突变:遗传物质发生改变
突变率:每一代中,每100万个基因中发生突变的次数,nX10-6/基因/代
基因突变导致的群体基因频率随世代数的增加呈指数规律下降,纯粹由突变引起的群体基因的改变非常缓慢
中性突变:基因突变后,对机体既未产生特殊益处,也未产生明显害处。
(2)自然选择(natural selection) 人类进化的主要推动力:反映环境因素对特定基因型和表型的作用,正性或负性。
,适合度(fitness)或适应值(adaptive value):
一个个体生存并将其基因传递给下一代的能力:
0(遗传致死性) 1(最佳等位基因)
某种遗传结构降低该基因型个体生育后代的能力和机会,即生育力下降。例如对丹麦软骨发育不良患者的调查,108名患者生育了 27个孩子,他们457个同胞生育了 582个孩子,如果以正常人的生育率=1,则患者的相对生育率为f= (27/108)/(582/457) =0. 20
,选择系数(selection coefficient, S )
偏离适合度1的部分定义为选择系数s, S = l-f
,平衡多态现象(balanced polymorphism)
突变基因由于杂合子的选择优势而形成的多态现象,如地中海贫血与疟疾。
, aa个体不能生育的性状
-致命性状
-经不起选择或降低生育适合度
?a等位基因的频率q以指数方式递减,频率趋于零,被称为减灭“,A则固定
?选择与突变之间的平衡
选择和突变对群体遗传结构的作用方向相反
选择压力:淘汰有害基因(生育年龄前去世或者不能生育)
突变压力:补充有害基因
-新的显性突变只有在将之传递给子代的前提下才能被确认。原则上讲,这种不能生殖的显性突变是不可能被认识的
绝大多数显性疾病降低携带者的平均生育力
在一个遗传平衡的群体中,选
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