分子克隆及蛋白表达常见问题和对策.ppt

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七、蛋白的诱导表达 各种表达系统的优缺点 七、蛋白的诱导表达 大肠杆菌蛋白诱导表达: 将测序正确的阳性克隆质粒转入BL-21plys大肠杆菌中,选取1-2个单克隆在LB或M9培养基上加入相应的抗生素培养,当菌体生长到OD600至0.7左右加入IPTG或其它诱导剂如乳糖等,诱导6-8小时收菌,超声破壁,离心,用未诱导或空载BL-21大肠杆菌为对照进行SDS-PAGA电泳。 七、蛋白的诱导表达 SDS-PAGA电泳后的胶进行考姆斯亮兰进行染色,对照不出现,而诱导后出现条带且分子量符合预期的视为阳性,诱导成功。 然后检查蛋白在上清还是在沉淀中,确定蛋白的可溶性。 大肠杆菌蛋白诱导表达 可能出现的情况及应对: 1、诱导后蛋白不表达 2、诱导后蛋白为包含体 3、表达的量不高 4、大肠杆菌不能生长 5、大肠杆菌前面生长良好,后期快速消失 七、蛋白的诱导表达 1、诱导后蛋白不表达 这种情况经常会出现,最大的可能性是克隆的基因不正确或者基因表达的阅读框不正确,如诱导2-3次后仍然不表达,建议回到测序的结果中再仔细检查,找到原因 七、蛋白的诱导表达 2、诱导后蛋白为包含体 包含体产生的原因有以下两个方面: -基因本身决定了其不溶性(真核基因/膜蛋白) -表达过快,来不及正确折叠 对于第一种情况,能改变的不多,采用共表达伴侣蛋白进行改善 对于第二种情况,可以通过降低诱导温度,采用温和诱导剂如(乳糖代替IPTG),加入相关的氨基酸(精氨酸),采用共表达伴侣蛋白效果更佳。 七、蛋白的诱导表达 3、诱导后蛋白表达的量不高 可通过高密度培养,增加细胞量; 可通过增加抗生素浓度减少质粒丢失; 可通过新型蛋白诱导表达方式,如巴奥得的天达1号,使蛋白(可溶性)表达及细胞量均得到明显提高;天达2号使蛋白(包含体)表达及细胞量均得到大幅提高。 七、蛋白的诱导表达 七、蛋白的诱导表达 4、大肠杆菌不能生长 可能的原因有抗生素用错了或要表达的是有毒基因: 有毒基因影响:宿主中质粒不稳定、抑制菌体生长或溶菌、表达量低或不表达 应对办法:启动子调控、抑制本底表达 选择特殊表达载体 PETco-co 选择宿主菌 BL-21(DE3)PlysS, BL-21(DE3)PlysE 包涵体表达 七、蛋白的诱导表达 5、大肠杆菌前面生长良好,后期快速消失 可能的原因是受到噬菌体污染: (1)?发酵液光密度上升缓慢,甚至下降,肉眼可见发酵液逐渐变清; (2)?耗糖速度缓慢或停止,产物生成量少或不增加,发酵液中残糖高; (3)产生大量泡末,发酵液呈粘稠状; (4?)菌体不规则,甚至出现畸形。? 一旦出现以上情况,立即进行环境消毒,不要抱有幻想 七、蛋白的诱导表达 噬菌体污染对策: 1?决不使用可疑菌种; 2?清除周围环境中存在的噬菌体。能灭菌的灭菌,能消毒的消毒,搞好清洁卫生工作; 3?选育抗噬菌体菌株 4?轮换使用菌株。因为一个菌株用的时间一长,就有可能出现该菌种的噬菌体。 药物防治: (1)螯合剂。如植酸盐(0.05~1%),柠檬酸盐(0.2~0.5%),草酸盐(0.2~0.5% ),三聚磷酸盐(0.5~1%)等可抑制噬菌体的吸附或阻止DNA的注入 七、蛋白的诱导表达 药物防治: (2)表面活性剂。0.01~0.2%的聚乙二醇单酯、聚氧乙烯烷基醚、土温20、土温60 等。主要作用于寄主细胞表面,抑制噬菌体在细菌上的吸附。 (3)抗菌素。如1ug/mL的金霉素、四环素、氯霉素等抑制噬菌体蛋白质的合成; (4)?N-脂酰氨基酸。是一类具有16~18个碳原子的衍生物。如20ug/mL的N-棕榈 酰-L-谷氨酸,其作用机制是抑制噬菌体核酸的复制或子代噬菌体的成熟 ? 七、蛋白的诱导表达 真核基因表达的调控——真核基因表达调控的特点 尽管我们现在对真核基因表达调控知道还不多,但与原核生物比较它具有一些明显的特点。真核基因表达调控的环节更多如前所述:基因表达是基因经过转录、翻译、产生有生物活性的蛋白质的整个过程。同原核生物一样,转录依然是真核生物基因表达调控的主要环节。但真核基因转录发生在细胞核(线粒体基因的转录在线粒体内),翻译则多在胞浆,两个过程是分开的,因此其调控增加了更多的环节和复杂性,转录后的调控占有了更多的分量。 七、蛋白的诱导表达 七、蛋白的诱导表达 图中标出了真核细胞在分化过程中会发生基因重排(gene rearrangement),即胚原性基因组中某些基因会再组合变化形成第二级基因。例如编码完整抗体蛋白的基因是在淋巴细胞分

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