生物信息学基因组分析详解演示文稿.pptVIP

HMM model for Gene Prediction (Genie) Kulp, D., PhD Thesis, UCSC 2003 现在是31页\一共有52页\编辑于星期三 (3) 可变剪切的预测 将EST, cDNA序列比对到基因组上 现在是32页\一共有52页\编辑于星期三 部分有向图算法 现在是33页\一共有52页\编辑于星期三 3. 比较基因组学 (1) 有功能的通常保守 (2) 例：SUMO底物的预测： a. SUMO化位点存在ψ-K-X-E模体 b. 核定位信号 (NLS) c. 人和小鼠中，SUMO化位点应当保守 d. 功能分析：Gene Ontology (3) 分析结果： a. 2,683个人-小鼠保守的SUMO化底物 b. SUMO化的功能：参与转录调控、信号转导等 现在是34页\一共有52页\编辑于星期三 Gene Ontology：基因本体论 1. 描述基因/蛋白质的功能 2. 三类术语(Term): a. Cellular component: 在哪里？ b. Biological process: 干什么？ c. Molecular function：我是谁？ 现在是35页\一共有52页\编辑于星期三 Gene Ontology：基因本体论 现在是36页\一共有52页\编辑于星期三 现在是37页\一共有52页\编辑于星期三 功能显著性分析：超几