园艺植物生物技术第八章.pptVIP

8.3.2 SSR（simple sequence repeats, 简单重复序列） Principle： 利用真核生物的基因组中普遍存在着二核苷酸、三核苷酸或四核苷酸的简单串联重复序列（CA）n、（AT）n、（GGC）n，在不同生物体之间其重复次数不同而产生多态性。重复序列的两侧往往有一小段保守的序列，根据此保守序列可设计特异引物进行PCR扩增，检测简单串联重复序列上的多态性。 第三十页，共六十八页，2022年，8月28日 第三十一页，共六十八页，2022年，8月28日 SSR 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 第三十二页，共六十八页，2022年，8月28日 How to get primers for SSR？ Query(查询)： Genbank、EMBL和DDBJ等DNA序列数据库搜索SSR序列。 Developing(开发) 首先建立DNA文库，筛选鉴定微卫星DNA克隆，然后测定这些克隆的侧翼序列，获得SSR座位两侧特异保守区的核苷酸序列，据此设计PCR引物。 第三十三页，共六十八页，2022年，8月28日 第三十四页，共六十八页，2022年，8月28日 Advantages and disadv