分子对接与药物虚拟筛选.pptxVIP

第1页/共50页分子对接与药物虚拟筛选第2页/共50页 分子对接的最初思想起源于Fisher E提出的“锁和钥匙模型”。即受体与配体的相互识别首要条件是空间结构的匹配 配体 受体 复合物 受体－配体的锁和钥匙模型 第3页/共50页 这类方法首先要建立大量化合物（例如几十至上百万个化合物）的三维结构数据库，然后将库中的分子逐一与靶标分子进行“对接”（docking），通过不断优化小分子化合物的位置（取向）以及分子内部柔性键的二面角（构象），寻找小分子化合物与靶标大分子作用的最佳构象，计算其相互作用及结合能。在库中所有分子均完成了对接计算之后，即可从中找出与靶标分子结合的最佳分子（前50名或前100名） Oh boy! What a perfect match第4页/共50页分子对接的基本原理药物与受体的结合强度取决于结合的自由能变化?G结合 = ?H结合 - T?S结合 = -RT ln Ki大部分的分子对接法忽略了全部的熵效应，而在焓效应也只考虑配体与受体的相互作用能，即：Einteraction= Evdw + Eelectrostatic + Eh-bond第5页/共50页§7.4.1 分子对接的基本方法（一） 刚性的分子对接方法 这种方法是最初的分子对接的方法，在对接中，小分子和蛋白质两种都保持刚性