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- 2023-05-08 发布于上海
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生物化学核酸杂交;本章内容;核酸分子杂交的基本原理
;
核酸变性
核酸复性
核酸杂交; 在化学和物理因素的影响下,维系核酸二级结构的氢键和碱基堆积力受到破坏,DNA双螺旋解旋成为单链的过程.
DNA变性后,理化性质和生物活性丧失。
; 物理因素:热(高温)
化学因素:酸、碱;
变性剂(如尿素、胍);
有机溶剂(如乙醇、丙酮);(二)变性温度(或解链温度,Tm):; (1)碱基组成:Tm=69.3+0.41(G+C)%
(2)分子大小:
(3)离子强度:
(3)pH:5~9
(4)变性剂:干扰碱基堆积力和氢键的
形成,降低Tm值。;
变性的DNA两条互补单链,在适当条件下重新缔合成双链的过程,又叫退火。;
复性导致DNA的紫外吸收降低,称为减色效应(hypochromic effect)。;(1)DNA大小:片段越小,复性越快;
反之亦然。
(2)离子强度:增加盐浓度可加速复性。
(3)DNA浓度:浓度越大,复性越快。
(4)若变性不彻底,复性很快。
(5)序列越简单,复性越快。
;DNA的变性和复性;三、核酸分子杂交
(nucleic acid hybridization ) ; 杂交可以发生在 DNA/DNA、DNA/RNA、
RNA/RNA、以及人工合成的寡核苷酸单链与
DNA或RNA之间。;液相杂交:
进行杂交的核酸都在杂交液中
特点: 杂交速度快,但误差较高
固相杂交:
将参加反应的核酸先固定在固相支持物上,与杂交液中的游离探针进行杂交
;; 第二节
核 酸 探 针
;
探针的概念
探针的种类和选择
探针的标记;一、探针(probe)的概念;二、探针(probe)的种类;基因组探针:用基因克隆技术分离获得的特异的DNA序列。
RNA探针:特异DNA序列在体外转录出的RNA序列。
cDNA探针:以特异mRNA序列为模板,在逆转录酶催化下合成的cDNA序列。
寡核苷酸探针(ASO):人工合成已知序列的寡核苷酸片段。;三、探针的标记物;四、探针的标记方法; 切口平移法(nick translation)
随机引物法 (random priming)
DNA的5’末端标记
PCR标记法
;第三节; 印迹杂交技术以固相杂交为基础.;一、固相支持物;二、印迹方法;三、印迹杂交过程;第四节; DNA印迹法
RNA印迹法
斑点杂交法
原??杂交
; 主要用于基因组DNA的定性和定量分析(特定序列定位),亦可分析重组质粒和噬菌体。;两个主要过程:
一是印迹(blotting)
二是分子杂交;;DNA分子杂交实验;放射自显影照片; 将RNA样品完全变性,通过琼脂糖凝胶电泳按分子大小分离,然后转移到固相膜上,固定后与探针进行杂交。; Northern blotting 的步骤;与DNA印迹的区别:
DNA印迹是先电泳后变性、转移;
RNA印迹是先变性后电泳、转移,且不能
采用碱变性;固定; 在细胞保持基本形态的情况下将探针注入细胞内与DNA或RNA杂交,杂交反应在载物片上的细胞内进行。 ;DNA点阵;本章重点:;44;感谢观看!
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