生物化学课件-第二章 蛋白质化学2.pptxVIP

第三节 肽;一、肽的基本概念;在多肽链中，氨基酸残基按一定的顺序排列，这种排列顺序称为氨基酸顺序。 通常在多肽链的一端含有一个游离的?-氨基，称为氨基端或N-端；在另一端含有一个游离的?-羧基，称为羧基端或C-端。 肽的顺序是从N-端的氨基酸残基开始，以C-端氨基酸残基为终点的排列顺序。如上述五肽可表示为： Ser-Val-Tyr-Asp-Gln 丝-缬-酪-天冬-谷氨酰胺肽;肽键:肽分子中，一个氨基酸分子的α-羧基与另一个氨基酸分子的α-氨基经脱水形成的酰胺键（-CO-NH）。 二肽.三肽:根据成肽的氨基酸数目命名。 10肽以下为寡肽，10肽以上为多肽。 氨基酸成肽后已不完整，称为氨基酸残基。 肽单位：与肽键相连的六个原子（C?1, C, O, N, H, C?2)组成的肽平面。;第四节 蛋白质的结构（重点）; 研究蛋白质结构需要搞清以下问题： 1．由哪些AA组成？ 2．AA之间是如何连接的？化学键的本质 3．AA的排列顺序。 4．各基团在空间的排布——构象。; 蛋白质是由各种氨基酸通过肽键连接而成的多肽链，再由一条或一条以上的多肽链按各自特殊方式组合成具有完整生物活性的分子。随着肽链数目、氨基酸组成及其排列顺序的不同，就有不同的三度空间结构也就形成了不同的蛋白质。;一、?? 蛋白质的一级结构（基本结构）1．定义：蛋白质分子中氨基酸（残基）的排列顺序。 维持力（连接方式）：肽键（酰胺键）肽键：是由一个AA的α-COOH与另一个AA基的α-NH2缩合 失水而成的化学键。?;蛋白质分子是由多个AA分子连接而成的多肽链。 N末端 C末端R1，R2，R3……Rn——侧链。 l??AA残基：组成多肽链的AA单位已不是完整的AA分子，因此 每个单位称为AA残基。l??两端：一条多肽链，其中一端保留着一个α-NH2，将此端叫做氨基末端（或N-端），通常将N端写在左边；另一端保留着一个自由的α-COOH叫羧基末端（或C-端），通常将C端写在右边。l??主链：由-NH-CH-CO-单位规则地重复排列而成。l??侧链：多肽链上???各种R基团维持蛋白质分子的立体结构和行 使蛋白质功能。 各种蛋白质，其AA种类、数目、比例、排列顺序各不相同。; 由胰脏中的胰岛? 细胞分泌分子量5734，51个AA。结构：由A和B两条肽链组成，A链：21个AA，B链：30个AA，两条链间以二硫键相连：A7-B7，A20-B19； 一条链内二硫键：A6-A11;蛋白质分子结构中的化学键：;蛋白质一级结构的测定;（一）、多肽链中氨基酸序列分析;蛋白质顺序测定的基本战略;测定N末端AA的方法;DNFB法分析N-端氨基酸残基;Edman降解法测定氨基酸序列;用途：末端基氨基酸测定;C—末端测定法;;※羧肽酶是一种肽链外切酶，它能从多肽 链的C-端逐个的水解。;肽链的部分水解和肽段的分离;胰蛋白酶（trypsin)的裂解作用;一级结构----基本结构;二、蛋白质的空间结构（高级结构）;肽平面的键长、键角;相邻肽平面的二面角;⑵ 决定蛋白质空间构象的因素 ① 蛋白质的氨基酸序列 ②肽键的刚性平面性质 由于C=O双键中的π电子云与N原子上的未共用电子对发生“电子共振”，使肽键具有部分双键的性质，不能自由旋转。 与肽键相连的六个原子构成刚性平面结构，称为肽单元或肽键平面，CO和NH呈反式排列。 但由于α-碳原子与其他原子之间均形成单键，因此两相邻的肽键平面可以α-碳原子作相对旋转，旋转的相对角度称Cα原子的两面角?和? ，可描述多肽的所有可能构象。 ;2.蛋白质二级结构;（1）?-螺旋:指肽链主链骨架围绕中心轴盘绕折叠所形成的有规则的结构，每圈螺旋含3.6个aa残基。螺旋的螺距为0.54nm，结构的稳定是靠链内的氢键。相邻两个氨基酸残基之间的轴心距为0.15nm。;l??维持螺旋的作用力是氢键，相邻螺圈之间 形成链内H键，H键的取向几乎与轴平行。　 H键位置：由每个残基的C＝O基与其相 邻的第四个残基的 －NH－的形成H键， 所有肽键的NH和CO都参与氢键的形成， 故α-螺旋很稳定。; l??天然蛋白质的α-螺旋几乎都是右手螺旋（极个别例外），右 手比左手螺旋稳定。 l?? 蛋白质多肽能否形成?-螺旋结构以及形成的螺旋体是否稳