研究生专题——关联分析.pptxVIP

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研究生专题——关联分析;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;单倍型;2023/3/30;A;A;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;LD随自由交配世代增加而衰减;例如,在最初时配子AB和ab的概率都为0.5,D0=1,处于完全连锁不平衡状态。 如果?=0.01,经过10代后,D10=0.2261 如果?=0.1,经过10代后,D10=0.0872 如果?=0.25,经过10代后,D10=0.0141 如果?=0.5,经过10代后,D10=0.0002 ;LD衰减与重组率的关系;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;第37页/共68页;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;两种方法如何选择?;2023/3/30;目标性状:玉米籽粒成分和淀粉特性 考察的性状:蛋白、油分和淀粉含量、直链淀粉含量、淀粉胶稠度、糊化温度 候选基因:amylose extender1(ae1), brittle endosperm2 (bt2), shrunken1 (sh1), sh2, sugary1, waxy1 结果: bt2, sh1和sh2与籽粒成分如蛋白、油分和淀粉含量显著关联 ae1和sh2与糊化温度显著关联 ae1和sh1与直链淀粉含量关联;全基因组关联分析;第45页/共68页;研究对象:包括7种常见病:躁郁症、冠状动脉粥样硬化、 小肠克罗恩氏病、类风湿关节炎、I型糖尿病、II型糖尿病和高血压;躁郁症;2023/3/30;Genome-wide association studies of 14 agronomic traits in rice landraces;3/30/2023;3/30/2023;3/30/2023;Regions of the genome showing association signals around known genes controlling heading date;Regions of the genome showing strong association signals near previously identified genes;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;2023/3/30;感谢观看!

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