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蛋白质通论学习;; ;蛋白质的组成;按组成分:;按生物学功能分:
酶、调节蛋白、结构蛋白、转运蛋白等
按形状分:
纤维状蛋白质、球状蛋白质、膜蛋白
按肽链的多少(相对分子质量)分:
单体蛋白质、寡聚蛋白质(多聚蛋白质);蛋白质的形状;蛋白质的大小与分子量;蛋白质分子量的变化范围很大,从大约6000到1000000道尔顿(Da)或更大。
某些蛋白质是由两个或更多个蛋白质亚基(多肽链)通过非共价结合而成的,称寡聚蛋白质。有些寡聚蛋白质的分子量可高达数百万甚至数千万。;;单体蛋白质:仅由一条多肽链构成
寡聚蛋白质:两条或多条多肽链构成,其中每条多肽链称为亚基,亚基之间通过非共价键相互缔合
不含辅基的蛋白质,用110除它的相对分子质量即可估计其氨基酸残基的数目。(蛋白质氨基酸的平均相对分子质量约为138,但在多数蛋白质中较小的氨基酸占优势,因此平均相对分子质量接近128,形成肽键时除去一分子水,所以氨基酸平均相对分子质量128-18=110);蛋白质的构象;蛋白质的结构层次;蛋白质的结构层次;蛋白质功能的多样性; 二 肽(peptide); 肽键(peptide bond);肽键平面的形成;肽键;肽键中的C-N键具有部分双键性质,不能自由旋转。C-N键约有40%的双键性质,而C-O键具有40%单键性质。
组成肽基的4个原子和2个相邻的Cа原子倾向于共平面,形成肽平面。两个Cа可以处于顺式构型或反式构型。在大多数情况下,以反式结构存在。但脯氨酸形成的肽键除外,可以是顺式,也可以是反式的。;第21页/共105页;肽单位;2.肽单位是刚性平面结构。即肽单位的6个原子都位于同一个刚性平面上,又称肽平面或酞胺平面。
3.肽单位中,C=O与N-H或两个α-碳原子呈反式排布。这是因为反式构型的能量比顺式构型的能量低。
4.肽单位平面结构有一定的键长和键角。;肽链中AA的排列顺序和命名;第25页/共105页;在多肽链中,氨基酸残基按一定的顺序排列,这种排列顺序称为氨基酸顺序
通常在多肽链主链的一端含有一个游离的氨基,称为氨基端或N-端;在另一端含有一个游离的羧基,称为羧基端或C-端。如果多肽链主链末端的氨基和羧基连接起来,则称环状肽或环肽。
氨基酸的顺序是从N-端的氨基酸残基开始,以C-端氨基酸残基为终点的排列顺序。肽的命名是根据参与其组成的氨基酸残基来确定的,规定从肽链的NH2末端氨基酸残基开始,称某氨基酰某氨基酰……某氨基酸。如上述五肽可表示为:
Ser-Val-Tyr-Asp-Gln
丝氨酰缬氨酰酪氨酰天冬氨酰谷氨酰氨;四肽的结构;(二)肽的重要理化性质;3. 具有旋光性。这是由于肽中有不对称C原子存在。一般短肽的旋光度约等于组成该肽中各个氨基酸的旋光度的总和。但是较长的肽,其旋光度则不等于其组成氨基酸的旋光度的简单加和。
4.具双缩脲反应。这是肽和蛋自质所特有的,而为氨基酸所没有的一个颜色反应。一般含有两个或两个以上肽键的化合物与CuSO4碱性溶液都能发生双缩脲反应而生成紫红色或蓝紫色的复合物,利用此反应借助分光光度法可测定肽或蛋白质含量。;5.具紫外吸收。如果肽中存在有酪氨酸、色氨酸和苯丙氨酸,则在280nm处有最大吸收峰。利用这个特性可对肽类进行定量测定。
6.其他反应。由于肽中存在游离的?-NH2和游离?-COOH,所以能进行茚三酮反应、酰化反应、酯化反应等许多反应。;第31页/共105页; 在给定的pH下,根据Henderson-Hasselbalch方程不难确定出每个侧链占优势的电离态。我们只需掌握这样一个规则:当溶液pH大于解离侧链的PKa值,占优势的离子形式是该侧链的共轭碱,当溶液的pH小于解离侧链的PKa值,占优势的离子形式是它的共轭酸,即:;第33页/共105页;第34页/共105页;第35页/共105页;(三)天然存在的重要多肽;与真核生物的RNA聚合酶??牢固结合;第38页/共105页;三 蛋白质的一级结构的测定; 2.蛋白质一级结构的测定;a、样品必需纯(97%以上);
b、知道蛋白质的相对分子量;
c、知道蛋白质由几个亚基组成;;蛋白质一级结构的测定; (2) 测定步骤;几条多肽链借助非共价键连接在一起,称为寡聚蛋白质,如,血红蛋白为四聚体,可用8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍或高浓度盐处理,即可分开多肽链(亚基);如果多肽链间是通过共价二硫桥连接的,如胰岛素,可采用氧化剂或还原剂将二硫键断裂。;第45页/共105页; (2) 测定步骤;第47页/共105页;;D 氨基酸组成的分析; 测定每条多肽链的氨基酸组成;第51页/共105页; (2) 测定步骤;San
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