系统生物学资料.pptxVIP

系统生物学资料;定义 (Definition);What is Systems Biology?;What is Systems Biology?;近几十年来发展最为迅速的生物科学; 分子生物学 与 系统生物学; 侧重从实验中获取数据;背景学科;系统生物学方法;;The Complete Proteomics Solution;Protein extract 1;质谱技术;测定肽混合物质量谱最有效的质谱仪是MALDI-TOF-MS。 基体辅助激光解吸（MALDI）在原理上利用激光束照射分散于基质中的样品，由于这些基质能够强烈吸收激光，从而保护了样品分子。 MALDI可离子化蛋白而又不破坏蛋白。 MALDI 与 TOF MS 的连用可以测定大分子如蛋白质的分子量，该技术精度高、分析时间短，可同时处理许多样品，是高通量鉴定的首选方法。;第15页/共49页;第16页/共49页;第17页/共49页;系统生物学与相关学科的关系;系统生物学与合成生物学的关系;传统分子生物学;;还原论及其局限性;“系统论是还原论和整体论的辩证统一” ----- 钱学森; 是生物学 是数据整合 是建模仿真 是系统科学; 第一步：对选定的某一生物系统的所有组分进行了解和确定，描绘出该系统的结构，包括基因相互作用网络和代谢途径，以及细胞内和细胞间的作用机理，以此构造出一个初步的系统模型。 第二步：系统地改变被研究对象的内部组成成分（如基因突变）或外部生长条件，然后观测在这些情况下系统组分或结构所发生的相应变化，包括基因表达、蛋白质表达和相互作用、代谢途径等的变化，并把得到的有关信息进行整合。 第三步：把通过实验得到的数据与根据模型预测的情况进行比较，并对初始模型进行修订。 第四步：是根据修正后的模型的预测或假设，设定和实施新的改变系统状态的实验，重复第二步和第三步，不断地通过实验数据对模型进行修订和精练。系统生物学的目标就是要得到一个理想的模型，使其理论预测能够反映出生物系统的真实性。;Four Aspects;第27页/共49页;自上而下 (Top-down，以Hood为代表) 自下而上 (Bottom-up，以Kitano为代表) 整合 (Integration) 扰动法 (Perturbation);整合－系统生物学的核心; 生命科学 信息科学 系统科学;生物学 物理学 化学 工程学 数学 计算科学;实验技术 （Wet Part） 信息技术 ???Dry Part）;实验技术;计算技术;数学的运用;涉及的生物学知识;生物信息资源;各种组学的研究进展;系统生物学的应用;第40页/共49页;研究机构与研究组织;Other famous institutes;国内机构;ICSB: International Conference on Systems Biology 11th, Edingburgh, UK, October 10-15, 2010 .uk WCSB: International Workshop on Computational Systems Biology, 7th. (Luxembourg, June 16-18, 2010) ICCSB: International Conference on Computational and Systems Biology, 2011 (Manila, Philippines, March 29-31, 2011);Molecular Systems Biology PLoS Computational Biology Bioinformatics (SB section) BMC Systems Biology BMC Bioinformatics Journal of Theoretical Biology Journal of Computational Biology in silico Biology Biosystems Molecular Biosystems Biophysical Journal IET Systems Biology Nature Science Cell PNAS….;中文参考书;English Books;Thank You !;感谢观看!