(71)--数量遗传学-第13讲-从QTL连锁分析到GWAS.pdfVIP

从QTL连锁分析到GWAS 1 GWAS的基本概念 全基因组关联分析（Genome wide association study，GWAS ）：利用全基因组范围内筛选出 高密度的分子标记，对所研究群体进行扫描， 分析扫描得出的分子标记数据与表型性状之间 的关联关系。即，GWAS是利用全基因组范围 内的连锁不平衡（linkage disequilibrium, LD ） 来确定影响某些表型性状的基因，挖掘与性状 变异相关的基因和位点。 GWAS 2 GWAS与QTL连锁分析 GWAS分析和QTL连锁分析，从统计学的角度 来讲是几乎没有区别的——都是统计基因型与 表型间的相关性； 适用于自然群体，研究材料来源广泛，可捕获 的变异丰富； 遗传标记类型丰富，单核苷酸多态性（SNP）、 插入缺失（InDel ）和结构变异（SV）等； 标记密度高，分辨率高，可达单碱基水平