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生物信息处理第1页/共21页序列分析第2页/共21页生物信息学的应用核酸序列分析指直接从基因组序列中获取信息，同时为后者提供数据；蛋白质序列分析中，大部分是对同源蛋白序列进行比对分析，以得到不同蛋白质之间的序列相关性，从而推测蛋白质功能等。二者分析方法一致。生物大分子包括DNA、RNA、蛋白质和脂类。它们的结构预测指建立精确的三维构象，这对于生物大分子功能的阐明十分重要。而尚无晶体结构数据的生物大分子，可采用分子模拟的方法预测大分子的三维结构。生物大分子结构预测在进行生物活性筛选之前，在计算机上对化合物分子进预筛选，以降低实际筛选化合物数目，同时提高先导化合物发现效率。虚拟筛选第3页/共21页药物发现中的生物信息学方法第4页/共21页一、核酸和蛋白质的序列分析(一) 单个序列分析 根据单个氨基酸物化性质推测整个蛋白质的性质，也可对序列进行统计分析，预测二级结构出现可能性. 20种氨基酸的疏水参数第5页/共21页 根据统计值：Glu经常出现在α-螺旋中；Val常在β-折叠中发现; Pro通常不出现于α-螺旋中和β- 折叠中而倾向于在回折中……（数值=1代表偏好处于平均；＞1代表偏好大于平均；＜1代表偏好小于平均）第6页/共21页(二) 双重序列比较——序列比对序列对比可以用各种矩阵表达并作相似性打分两个残基越相似则打分值越高.第7页/共21页(三) 多重序列比对多重序列比对可更多揭示